Análise genômica comparativa e evolutiva do genoma do monoxeno Blechomonas sp. TCC303E

Abstract

Acima de tudo, agradeço ao meu Deus, por seu mistério infinito onde dia a dia nós cientistas trabalhamos para entendê-lo um pouco mais.A minha mãe Lila Tantalean Campos e minha irmã Leidy Yannina Calderon Tantalean por serem minha força e empolgação para ser melhor a cada dia e a esse amor infinito que nos une, e também agradeço a meu amor de pandemia (agora noiva) Samara Spagnolo Sousa por sua parceria e companhia que me faz sentir bem cada dia. Agradeço também ao meu melhor amigo Hachi, por todos os momentos de diversão e tristeza juntos e aquele amor incondicional que os cães têm por seus donos, descanse em paz meu amigo.Ao Prof. João Marcelo Pereira Alves, mais conhecido pelo "J" por abrir as portas de seu laboratório para mim, pela oportunidade de fazer parte do time Labo 40; pela paciência e a confiança depositada para o desenvolvimento deste trabalho.Ao pessoal do lab. 40, Percy Omar Túllume Vergara e Anderson Carvalho Morais, obrigado pelo apoio e das dicas neste trabalho de mestre e também pela sua amizade. A Guillermo Uceda Campos pelas conversas e apoio sobre diversos assuntos.À Universidade de São Paulo, às agências de fomento à pesquisa CAPES pelo apoio financeiro. E para você, que embora seu nome não esteja listado nestes agradecimentos, mais que também contribui de alguma forma ou outra no desenvolvimento deste projeto. Só tenho a agradecer a todos vocês, muito obrigado! RESUMO O conhecimento dos tripanossomatídeos vem principalmente dos heteroxenos que foram muito mais estudados por terem impactos negativos na sociedade, deixando o maior grupo de tripanossomatídeos (monoxenos) quase esquecido por muito tempo. No entanto, os monoxenos se tornaram relevantes recentemente por serem bons modelos para entender a origem do parasitismo e a evolução dos heteroxenos, devido a serem basais a todos os heteroxenos importantes e compartilharem características genéticas comuns, além de co-infectar os hospedeiros desses heteroxenos. Diante dessa necessidade, este estudo tem como objetivo caracterizar o genoma do monoxeno Blechomonas sp. TCC303E (Classe Kinetoplastea; subfamília Blechomonadinae) através de técnicas bioinformáticas para analisar aspectos genômicos e evolutivos desse organismo, expandindo assim a disponibilidade de dados genéticos deste gênero, que até agora tinha disponível apenas a sequência genômica da espécie-tipo, Blechomonas ayalai. Blechomomas são parasitas extremamente polimórficos e exclusivos das pulgas (Siphonaptera), as quais podem transmitir agentes etiológicos de doenças veterinárias e médicas. Nossos resultados mostram uma montagem com uma cobertura média de 38,6 vezes, de boa qualidade e composta de 728 scaffolds, com N50 de ~61 kbp e uma média de GC de 50,3%. Um dos scaffolds contém DNA mitocondrial, com uma média de GC de 19,7%. Foram preditos 8.044 CDS, das quais foram anotadas funcionalmente 7.002, além de genes de RNAs: 71 tRNAs, 4 rRNAs, 62 RNAs não codificantes. A análise de sintenia mostrou que Blechomonas mantém uma arquitetura genômica semelhante à dos demais tripanossomat...