An operational robotic pollen monitoring network based on automatic image recognition

Oteros, José; Weber, Anna; Kutzora, Susanne; Rojo, Jesús; Heinze, Stefanie; Herr, Caroline; Gebauer, Robert; Schmidt‐Weber, Carsten B.; Buters, Jeroen

doi:10.1016/j.envres.2020.110031

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“…Andersherum sind bestimmte Daten zwar nahezu in Echtzeit, aber keineswegs flächendeckend verfügbar, z. B. Echtzeitdaten zur Pollenkonzentration [ 18 ]. Gleichzeitig kommt es durch spezielle rechtliche und ethische Rahmenbedingungen in der Medizin und dem Gesundheitswesen, insbesondere durch die Tatsache, dass die Auswertung von sensiblen und damit besonders schützenswerten Daten oftmals im Spannungsfeld konkurrierender Interessen oder Verordnungen steht, hierzulande noch zu starken Einschränkungen [ 32 ].…”

Section: Daten Im Gesundheitswesenunclassified

“…Vielmehr kann es als Anforderung angenommen werden, alle verfügbaren Daten auf ihre Anwendbarkeit „als Basis für Auswertungen im Sinne der wissenschaftlichen Fragestellung“ zu prüfen [ 28 ]. Angetrieben durch die Digitalisierung des Gesundheitssektors, ergaben sich eine beinahe unbegrenzt vielfältige Datenbasis und die Möglichkeit zu innovativen Datenanalysen: Gesundheits-Apps und Wearables, die das Gesundheitsverhalten messen, das Krankheitsgeschehen dokumentieren und Real-time-Aktivitätsprofile erstellen [ 17 , 18 , 27 ], gesundheitsbezogene Informationen von auf partizipativen Online-Plattformen oder sozialen Medien geteilten Inhalten [ 5 ] und Suchanfragen über Internetsuchmaschinen; alles Daten(quellen), die als Basis zur Sekundärdatenanalyse herangezogen werden können.…”

Section: Digitalisierung Im Gesundheitsbereichunclassified

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Websearch-Daten als Gesundheitsdaten?

2021

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Zusammenfassung Hintergrund Die eingeschränkt zeitnahe, kostengünstige und regionale Verfügbarkeit von Daten im Gesundheitswesen gilt als einer der limitierenden Faktoren für zeitgerechte Analysen im Bereich der Versorgungsforschung und damit für die Gesundheitsversorgung der allgemeinen Bevölkerung. Deshalb geraten zunehmend Internetsuchmaschinenanalysen in den Fokus. Fragestellung Welchen Beitrag können Daten zum Internetsuchvolumen zu verschiedenen Erkrankungen in der Gesundheitsversorgung der deutschen Bevölkerung leisten? Wo liegt das Potenzial, und wo gibt es Grenzen? Material und Methoden Es erfolgten die Aufbereitung der aktuellen Literatur sowie eine selektive Übersicht der in den letzten 4 Jahren veröffentlichten Suchmaschinenanalysen zu dermatologischen, allergologischen und infektiologischen Erkrankungen in Deutschland. Ergebnisse Durch die Analyse von Suchmaschinendaten konnten zeitliche Entwicklungen wie Saisonalität, Monate mit dem höchsten Suchinteresse und geografische Unterschiede auf nationaler, Bundesländer- und Städteebene abgebildet und Interessenschwerpunkte bezüglich eines die Krankheit betreffenden Themas (z. B. Hautkrebs am Auge oder analer Juckreiz) aufgezeigt werden. Darüber hinaus fanden manche Studien einen Zusammenhang zwischen dem Suchvolumen und externen Faktoren (z. B. Temperatur, ärztliche Versorgungsstruktur) sowie zu registrierten Fällen (z. B. Hautkrebs, Borreliose). Schlussfolgerung Internetsuchmaschinendaten liefern als nahezu in Echtzeit verfügbare Datenquelle unter Berücksichtigung der aufgezeigten Fallstricke ein räumlich-zeitliches Abbild hinsichtlich der Bedürfnisse der internetnutzenden Bevölkerung. Sie können besonders nützlich in Situationen sein, in denen traditionelle Gesundheitsdaten begrenzt oder nicht vorhanden sind.

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Section: Daten Im Gesundheitswesenunclassified

Section: Digitalisierung Im Gesundheitsbereichunclassified

Websearch-Daten als Gesundheitsdaten?

2021

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“…under the umbrella of the European grouping of national meteorological services, EUMETNET. 50 This 5-year programme brings together a wide range of actors from across Europe involved in pollen monitoring, some already with operational automatic monitoring sites (e.g., 51,52 ). AutoPollen aims to establish a prototype of a fully automatic pollen monitoring network, develop standards, foster collaboration across Europe and support wide exchange and use of data.…”

Section: Within This Context the Autopollen Programme Began In 2018mentioning

confidence: 99%

“…To meet the end-user needs outlined above, a comprehensive strategy and integrated infrastructure needs to be put in place (see Figure 1). Existent automatic monitoring networks 51,52 as well as those in the development or planning stages are currently collaborating together through the EUMETNET AutoPollen Programme. 50 While this programme is coordinating the nascent network of stations, this will need to be reinforced and further extended to form a 'backbone' network across all of Europe.…”

Section: Responding To End-user Needs-the Ideal Pan-european Pollen Mmentioning

confidence: 99%

The need for Pan‐European automatic pollen and fungal spore monitoring: A stakeholder workshop position paper

Tummon

Arboledas

Bonini

et al. 2021

Clinical & Translational All

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Background: Information about airborne pollen concentrations is required by a range of end users, particularly from the health sector who use both observations and forecasts to diagnose and treat allergic patients. Manual methods are the standard for such measurements but, despite the range of pollen taxa that can be identified, these techniques suffer from a range of drawbacks. This includes being available at low temporal resolution (usually daily averages) and with a delay (usually 3-9 days from the measurement). Recent technological developments have made possible automatic pollen measurements, which are available at high temporal resolution and in real time, although currently only scattered in a few locations across Europe.This is an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits use, distribution and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.

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“…Thus, important efforts have been deployed in the last years in finding alternative automated methods for single pollen grain identification. Some of the most exploited and promising approaches are based on the image analysis (Lagerstrom et al, 2015;Oteros et al, 2015Oteros et al, , 2020Sauvageat et al, 2020), spectroscopy techniques (Kendel and Zimmermann, 2020;Mondol et al, 2019) and molecular biology (Leontidou et al, 2018;Rojo et al, 2019).…”

Section: Accepted Manuscriptmentioning

confidence: 99%

Automated Microscopy Techniques on Passively Collected Samples Provide Reliable Quantitative Data on Airborne Pollen

Gottardini

Cristofolini

Cristofori

et al. 2021

Aerosol Air Qual. Res.

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Data on airborne particles are of great importance for human health. Anthropogenic (e.g. soot, tire and brake wear) as well as biogenic (e.g. pollen, spores) particles are usually monitored by active samplers located in urban environments; thus, very few data are available for remote, mountainous areas. In addition, bioaerosol analysis is time-consuming and skill-demanding. This study was carried out to explore if passive sampling combined with automated analysis methods for pollen detection could be an option to overcome the constraints of active sampling (i.e. costs, electricity need) and to simplify data analysis. For this purpose, two Sigma-2 passive samplers were exposed during twelve one-week periods in 2018 in San Michele a/A (Italy), where airborne pollen has been monitored since 1990 by a volumetric Hirst-type sampler. Samples were analyzed by (i) automated optical microscopy (OM) followed by image analysis based on particle size and grey values, and (ii) automated scanning electron microscopy coupled to energy dispersive x-ray spectroscopy (SEM/EDX), delivering morpho-chemical information of single particles. By the automated OM, bright particles (i.e. from natural source) in the size range of 20-80 µm well represented the total pollen amount. By filtering the particles for size, shape and chemical composition, the SEM/EDX allowed to select the pollen-like fraction. In conclusion, automated analytical approaches can simultaneously provide data on anthropogenic, geogenic and biogenic airborne particles, including pollen. In addition, passive sampling is a reliable option for aerobiological studies, especially suitable in remote areas, where the maintenance of active samplers is challenging.

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An operational robotic pollen monitoring network based on automatic image recognition

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Websearch-Daten als Gesundheitsdaten?

Websearch-Daten als Gesundheitsdaten?

The need for Pan‐European automatic pollen and fungal spore monitoring: A stakeholder workshop position paper

Automated Microscopy Techniques on Passively Collected Samples Provide Reliable Quantitative Data on Airborne Pollen

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