An insight into gut microbiota and its functionalities

Adak, Atanu; Khan, Mojibur R.

doi:10.1007/s00018-018-2943-4

Cited by 644 publications

(398 citation statements)

References 173 publications

Supporting

Mentioning

360

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Söz konusu bakterilerin vücutta oluşturduğu bu bakteri topluluğu mikrobiyota olarak tanımlanmaktadır. 1 Mikrobiyotanın çeşitliliği ve yerleşimi çeşitli faktörlerden etkilenmektedir. Mikrobiyota çeşitliliği, ayrıca pek çok hastalık ile de ilişkilendirilmekte, patolojik durumlar üzerinde etki göstermektedir.…”

Section: Probiyotiklerin Toksikolojik Açıdan Değerlendirilmesiunclassified

“…3 Probiyotikler, Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) tarafından "yeterli miktarda verildiğinde, hastaya yarar sağlayan canlı mikroorganizmalar" olarak tanımlanmaktadır. 1,3 Probiyotikler hakkında yapılan araştırmalar çok yeni olmakla birlikte, insanlar farkında olmadan, başta fermente gıdalar aracılığı ile olmak üzere çok uzun yıllardır probiyotikleri kullanmaktadır. 1 Probiyotikler günümüzde, insan hayatı içinde çok fazla yer kaplamaktadır.…”

Section: Probiyotiklerin Toksikolojik Açıdan Değerlendirilmesiunclassified

“…1,3 Probiyotikler hakkında yapılan araştırmalar çok yeni olmakla birlikte, insanlar farkında olmadan, başta fermente gıdalar aracılığı ile olmak üzere çok uzun yıllardır probiyotikleri kullanmaktadır. 1 Probiyotikler günümüzde, insan hayatı içinde çok fazla yer kaplamaktadır. Dünya çapında yılda neredeyse 20 milyar doz probiyotik insanlar tarafından kullanılmaktadır.…”

Section: Probiyotiklerin Toksikolojik Açıdan Değerlendirilmesiunclassified

“…4,5 Vücuttaki yararlı mikroorganizma sayısını artırmak amacıyla besin olarak prebiyotikler de diyetlerde yerini almaktadır. 1,6 Probiyotiklerin yararlı etkileri olduğu bilinmekle beraber, bu preparatların güvenli kullanımı üzerine hâlâ yeterince çalışma bulunmamaktadır. Bir probiyotik preparat piyasaya sunulurken, bakteri suşu üzerine yapılması zorunlu olan testler bulunmaktadır.…”

Section: Probiyotiklerin Toksikolojik Açıdan Değerlendirilmesiunclassified

See 3 more Smart Citations

Toxicological Evaluation of Probiotics

Özmen¹,

Sabuncuoğlu²

2020

J Lit Pharm Sci

View full text Add to dashboard Cite

ÖZET İnsan vücudunda kendi hücrelerinden çok daha fazla sayıda bakteri yaşamaktadır. Bakterilerin vücutta oluşturduğu bu bakteri topluluğu mikrobiyota olarak ifade edilmektedir. Genel kullanım alanlarına bağlı olarak probiyotikler, kalitatif veya kantitatif olarak bağırsak mikroflorasını değiştirebilen, bağışıklık sistemini destekleyerek yararlı etkilerini tetikleyen, canlılar tarafından tüketilen canlı mikroorganizmalar şeklinde tanımlanmaktadır. Probiyotiklerin yararlı etkileri olduğu bilinmekle beraber, bu preparatların güvenli kullanımı üzerine yeterince çalışma bulunmamaktadır. Bu durum, kontrolsüz bir şekilde bu kadar yaygın olarak kullanılan probiyotiklerin güvenliliklerinin de sorgulanmasını gerektirmektedir. Bu derlemede, tüm dünyada çok popüler olan ve yeterli miktarda verildiğinde hastaya yarar sağlayan canlı mikroorganizmalar olarak tanımlanan probiyotiklerin kullanımının toksikolojik açıdan güvenirliliği ve risk analizi değerlendirilmiştir. Anah tar Ke li me ler: Mikrobiyota; probiyotik;probiyotik güvenlik ve toksisitesi ABS TRACT The number of bacteria in the human body is much higher than their own cell count. This bacterium formed by bacteria in the body is defined as microbiota. Depending on their general field of use, probiotics are defined as living microorganisms that can either qualitatively or quantitatively alter intestinal microflora, support the immune system and trigger beneficial effects. These bacteria have health effects as well as the drugs used and the additional probiotics taken have an effect on the microbiota. Probiotics are known to have beneficial effects, but there is still insufficient study on the safe use of these preparations. This requires an uncontrolled questioning of the safety of such widely used probiotics. In this review, toxicological safety and risk analysis of probiotics identified as living microorganisms, which are very popular all over the world and given sufficient amounts, are evaluated.

show abstract

Section: Probiyotiklerin Toksikolojik Açıdan Değerlendirilmesiunclassified

See 2 more Smart Citations

Toxicological Evaluation of Probiotics

Özmen¹,

Sabuncuoğlu²

2020

J Lit Pharm Sci

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Many studies have showed that mouse intestinal models also play a pivotal role in human gut microbial research. Some phyla in mouse intestinal flora, such as Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, has resemblances with that in human (7, 8). In addition, there are plenty of similarities in anatomy, genetics and physiology between mouse and human (9).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 98%

Analysis of metagenome-assembled genomes from the mouse gut microbiota reveals distinctive strain-level characteristics

Zhang

et al. 2020

Preprint

View full text Add to dashboard Cite

21The laboratorial mouse harbors a unique gut microbiota with potential value for human microbiota-22 associated studies. Mouse gut microbiota has been explored at the genus and species levels, but features 23 rarely been showed at the strain level. The identification of 833,051 and 658,438 nonredundant genes of 24 faeces and gut content samples from the laboratorial C57/BL mice showed over half of these genes were 25 newly found compared to the previous mouse gut microbial gene catalogue. Metagenome-assembled 26 genomes (MAGs) was used to reconstruct 46 nonredundant MAGs belonging to uncultured specieses. These 27MAGs included members across all phyla in mouse gut (i.e. Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, 28 Deferribacteres, Verrucomicrobia, and Tenericutes) and allowed a strain-level delineating of the mouse gut 29 microbiota. Comparison of MAGs with human gut colonies revealed distinctive genomic and functional 30 characteristics of mouse's Bacteroidetes and Firmicutes strains. Genomic characteristics of rare phyla in 31 mouse gut microbiota were demonstrated by MAG approach, including strains of Mucispirillum schaedleri, 32Parasutterella excrementihominis, Helicobacter typhlonius, and Akkermansia muciniphila. 33 Importance 34 The identification of nonredundant genes suggested the existence of unknown microbes in the mouse gut 35 samples. The metagenome-assembled genomes (MAGs) instantiated the specificity of mouse gut species and 36 revealed an intestinal microbial correlation between mouse and human. The cultivation of faeces and gut 37 contents sample validated the existence of MAGs and estimate their accuracy. Full-length 16S ribosomal 38 RNA gene sequencing enabled taxonomic characterization. This study highlighted a unique ecosystem in the 39 gut of laboratorial mice that obviously differed with the human gut flora at the strain level. The outcomes 40 may be beneficial to researches based on laboratorial mouse models. 41 42 Introduction 43The gut microbiota is a dense and diverse ecosystem (1). The associations between altered gut microbial 44 composition and various pathogenesis, such as obesity (2, 3), type 2 diabetes (4), rheumatoid arthritis (5), 45 and allergy (6), has become a research hotspot. Murine models, especially mouse, are widely used in 46 biomedical study. Many studies have showed that mouse intestinal models also play a pivotal role in human 47 gut microbial research. Some phyla in mouse intestinal flora, such as Firmicutes, Bacteroidetes, 48Proteobacteria, has resemblances with that in human (7, 8). In addition, there are plenty of similarities in 49 anatomy, genetics and physiology between mouse and human (9). These features make the mouse one of the 50 most essential model animals in laboratory. However, mouse gut microbiota could be influenced by many 51 factors, including diet, ambient temperature and cleanliness. Hence, there are still some distinctions between 52 human and mouse gut microbiota. Previous studies have showed that over 50% of genera in mouse gut 53 microbi...

show abstract

The Gut Microbiome in Melanoma: A Piece of a Complex Puzzle

Greene,

Nelson

2023

JAMA Dermatol

View full text Add to dashboard Cite

An insight into gut microbiota and its functionalities

Cited by 644 publications

References 173 publications

Toxicological Evaluation of Probiotics

Toxicological Evaluation of Probiotics

Analysis of metagenome-assembled genomes from the mouse gut microbiota reveals distinctive strain-level characteristics

The Gut Microbiome in Melanoma: A Piece of a Complex Puzzle

Contact Info

Product

Resources

About