A PCR-free point-of-care capacitive immunoassay for influenza A virus

Cheng, Cheng; Cui, Haochen; Cheng, Cheng; Eda, Shigetoshi

doi:10.1007/s00604-017-2140-4

Cited by 30 publications

(20 citation statements)

References 33 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Another difference is that ACET velocity will become stronger with increasing fluid ionic strength, while DEP velocity will decrease through the influence of Clausius–Mossotti factor. Order of magnitude estimation of ACEK velocities using equations in our previous work and a DNA length of 52 μm found that the ratio of average DEP velocity to ACET velocity is calculated to be 278, suggesting that pDEP will be the dominant enrichment mechanism.…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 84%

“…Another difference is that ACET velocity will become stronger with increasing fluid ionic strength, while DEP velocity will decrease through the influence of Clausius-Mossotti factor. Order of magnitude estimation of ACEK velocities using equations in our previous work [52] and a DNA length of 52 m [53] found that the ratio of average DEP velocity to ACET velocity is calculated to be 278, suggesting that pDEP will be the dominant enrichment mechanism. In order to evaluate and optimize the effect of AC electrical fields, two different voltages (10 and 25 mV) are applied and the sensor responses to various concentration of HSV-1 DNA in 2 × SSC are given in Fig.…”

Section: Sensor Performance Under Different Applied Voltagesmentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

Capacitive DNA sensor for rapid and sensitive detection of whole genome human herpesvirus‐1 dsDNA in serum

et al. 2017

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

This work presents a rapid, highly sensitive, low-cost, and specific capacitive DNA sensor for detection of whole genome human herpesvirus-1 DNA. This sensor is capable of direct DNA detection with a response time of 30 s, and it can be used to test standard buffer or serum samples. The sensing approach for DNA detection is based on alternating current (AC) electrokinetics. By applying an inhomogeneous AC electric field on sensor electrodes, positive dielectrophoresis is induced to accelerate DNA hybridization. The same applied AC signal also directly measures the hybridization of target with the probe on the sensor surface. Experiments are conducted to optimize the AC signal, as well as the buffers for probe immobilization and target DNA hybridization. The assay is highly sensitive and specific, with no response to human herpesvirus-2 DNA at 5 ng/mL and a LOD of 1.0 pg/mL (6.5 copies/μL or 10.7 aM) in standard buffer. When testing the double stranded (ds) DNA spiked in human serum samples, the sensor yields a LOD of 20.0 pg/mL (129.5 copies/μL or 0.21 femtomolar (fM)) in neat serum. In this work, the target is whole genome dsDNA, consequently the test can be performed without the use of enzyme or amplification, which considerably simplifies the sensor operation and is highly suitable for point of care disease diagnosis.

show abstract

Section: Resultsmentioning

confidence: 84%

Section: Sensor Performance Under Different Applied Voltagesmentioning

confidence: 99%

Capacitive DNA sensor for rapid and sensitive detection of whole genome human herpesvirus‐1 dsDNA in serum

et al. 2017

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Многопараметричний аналіз генетичного матеріалу з використанням ДНК-мікроматриць (мікрочипів), представляючих собою массив іммобілізованих на твердій фазі олігонуклеотидів, здатних специфічно звязуватися с детектуючими послідовностями. Для ідентифікаціїі типування вірусу грипу підтипів H1N1 та H7N9 описані мікрочипи двух типів: ДНКмікроматриці високої щільності і спеціалізовані олігонуклеотидні мікрочипу [21]. До недоліків мікрочипів низької щільності відноситься їх неуніверсальність: вони придатні тільки для ідентифікації і типування вірусу грипу, або субтипування вірусу грипу А, або для аналіза стійкості до обмеженої кількості антивірусних препаратів.…”

Section: пдрф аналіз та електрофореграма до рестриктазunclassified

Development of anexpress-method for influence and genotyping of H1N1 and H7N9 virus avian influenza a strains by PCR-RFLP analysis

Buriachenko¹,

Stegniy²

2019

ScienceRise: Biological Science

View full text Add to dashboard Cite

Епізоотичний моніторинг останніх років свідчить про те, що високопатогенний вірус грипу А птахів (H1N1) та (H7N9) активно циркулює на території Євразійських держав. За 2016-2019 рр. було зафік-совано1,6 тис. випадків спалахів. З них у Європі 872 випадки. Питання моніторингу за інфікованою як перелітною так і свійською птицею в місцях перехресного контакту в Україні є актуальним для запобігання виникнення спалахів епізоотії. Мета дослідження. Розробити експрес-метод ідентифікації та визначення вірусу пташиного грипу А Н1N1 та Н7N9 штамів на основі полімеразної ланцюгової реакції з аналізом поліморфізму довжин рестрикційних фрагментів (ПЛР-ПДРФ) РНК вірусу. Результати та обговорення. Проведений аналіз in silico ампліконів генів HA, NA та NP дозволив in silico розрахувати праймери до варіабельних локусів досліджуваних генів, розрахувати умови проведення реакції, визначити сайти рестрикції до добраних рестриктаз отримати теоретичні електрофореграми ПЛР-ПДРФ аналізу. Розроблено методику експрес-методу для виявлення та ідентифікації вірусу грипу А H1N1 та H7N9 за трьома генами (HA, NA та NP) РНК H1N1 та H7N9 у полімеразній ланцюговій реакції ПЛР суміщеній з ПДРФ аналізом. Метод експрес-діагностики здатний виявляти вірус пташиного грипу А H1N1 та H7N9 і диференціювати його від зразків інших збудників вірусних інфекцій птахів і тварин. Висновки. Розроблений метод експрес-ідентифікації на основі ПЛР суміщений з ПДРФ аналізом дає можливість значно спростити метод ідентифікації за рахунок специфічної ампліфікації ділянки РНК, що має поліморфний сайт рестрикції. Тестування стану цього локуса можливе шляхом попереднього проведення ПЛР та рестрикції ампліфікованого фрагменту. Встановлено, що метод експрес-діагностики ПЛР-ПДРФ здатний виявляти РНК вірус грипу А високопатогенних штамів H1N1 та H7N9 з високими показниками чутливості (100 % чутливість) Ключові слова: високопатогенний вірус пташиного грипу А H1N1, H7N9, експрес-метод діагностики ПЛР-ПДРФ, консервативні мотиви, варіабельні локуси, поліморфізм

show abstract

“…Although PCR techniques have been developed for more than 30 years, the operation is still complicated, and the required turnaround time cannot be shorter than several hours [15]. Based on the good specificity and versatile sensing mechanisms, bio-probe based sensors for virus detection are becoming more practicable in recent years as promising approaches [19][20][21]. Also due to the high specificity, reproducibility, and stability, antibody based detections of causative agent are continually adopted in food safety detection [29,30].…”

mentioning

confidence: 99%

Real-time Sensing of Trace Biomarkers from Viruses with a Microfluidic Immunosensor: A Case Study of SARS-CoV-2 Detection in Cold-chain Food

Qi¹,

Zhang

Cheng³

et al. 2020

Preprint

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

A PCR-free point-of-care capacitive immunoassay for influenza A virus

Cited by 30 publications

References 33 publications

Capacitive DNA sensor for rapid and sensitive detection of whole genome human herpesvirus‐1 dsDNA in serum

Capacitive DNA sensor for rapid and sensitive detection of whole genome human herpesvirus‐1 dsDNA in serum

Development of anexpress-method for influence and genotyping of H1N1 and H7N9 virus avian influenza a strains by PCR-RFLP analysis

Real-time Sensing of Trace Biomarkers from Viruses with a Microfluidic Immunosensor: A Case Study of SARS-CoV-2 Detection in Cold-chain Food

Contact Info

Product

Resources

About