A high frequency of the PAX6 gene 3'-cis-regulatory region deletions in Russian aniridia patients

Abstract

Врожденная аниридия (OMIM#106210) (ВА) - наследственное аутосомно-доминантное заболевание, ассоциированное с внутригенными мутациями гена PAX6 или крупными хромосомными аберрациями с вовлечением региона 11p13 в гетерозиготном состоянии. Проведено изучение особенностей спектра мутаций гена PAX6 и региона 11p13 в когорте пациентов с ВА из России. Обследованы 184 пациента из 152 неродственных семей. У 17 пациентов из 12 неродственных семей в регионе 11p13 обнаружены сходные делеции дистантной 3'-цис-регуляторной области гена PAX6 размером 0,3-1,5 млн п.н. Частота 3'-цис делеций составила 8% (12/152) и превысила частоту обычной нонсенс мутации в гене PAX6 c.718C>T (9/152, 6%). Высокая частота делеций указывает на возможно общий механизм их образования в «горячем» локусе региона 11p13. Aniridia (OMIM 106210) is an autosomal dominant congenital disorder caused by heterozygous PAX6 intragenic mutations or chromosome 11p13 rearrangements. Molecular genetic study aimed to determine PAX6 damage spectrum peculiarities in Russian cohort. 152 unrelated families with congenital aniridia (184 patients) underwent ophthalmic examination and DNA testing. 17 patients from 12 unrelated families (4 familial and 8 sporadic probands) shared likely the same 11p13 0.3-1.5 Mb deletion affecting PAX6 downstream regulatory regions. The frequency of these deletions, 8% (12/152), was higher than PAX6 hotspot c.718C>T rate (8/152, 6%). A high rate of the deletions suggests a common underlying mechanism of its formation and points to 11p13 genomic region instability.