A COMPARATIVE ANALYSIS OF GENOMIC CHARACTERS OF REFERENCE Sinorhizobium meliloti STRAINS, THE ALFALFA SYMBIONTS (review)

Abstract

the primary center of the diversity of their host plants whereas those sequences are lost under an abiotic stress (salinity) impact. In addition, strains harboring different chromosome types, according to structural differences in the intergenic sequence of rrn-rrl operons, can be referred to divergent clonal lineages. According to the discussed data, it was suggested to consider strain 425a and its derivatives as the model S. meliloti strains to create a system for genetic monitoring of practically valuable strains in agrocenoses.

HIGHLY EFFECTIVE ROOT NODULE INOCULANTS OF ALFALFA (Medicago varia L.): MOLECULAR-GENETIC ANALYSIS AND PRACTICAL USAGE IN CULTIVAR CREATION

“…М о л е к у л я р н о -г е н е т и ч е с к и й а н а л и з ш т а м м о в. Мы провели сравнительный анализ геномов высокоэффективных штаммов А1, А2 и 425а с использованием ДНК-биочипа SM6kOligo, сконструированного на основе генома референсного штамма Rm1021 (49). Установлено, что в геноме проанализированного штамма СХМ1 (49) -стрептомицинустойчивого мутанта штамма 425а отсутствуют 508 ОРС (открытые рамки считывания), а у штаммов А1 и А2 -соответственно 601 и 432 ОРС, однако их последовательности могут присутствовать, но иметь значительные структурные изменения.…”

“…Был проведен анализ штаммов А1 и А2 и 425а на наличие дополнительных элементов генома, или геномных островов (ГО), которые имеют фаговое происхождения и участвуют в процессе горизонтального переноса генов (49). Анализ контигов, полученных для штаммов А1 и А2 и 425а, позволил выявить шесть ГО, наличие которых в геномах исследуемых штаммов было подтверждено с использование метода ПЦР детекции (см.…”

Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti Strain CXM1-105

“…Sinorhizobium meliloti CXM1-105 is a UV-light-obtained mutant of strain CXM1, which is a spontaneous streptomycin-resistant mutant of commercial strain 425a, which was recovered from Medicago sativa subsp. varia nodules in Kazakhstan (1 – 3). CXM1-105 has been used as a reference strain in plant tests and as a model strain in genetic experiments (1 – 4).…”