Untitled

Abstract

Tóm tắt: Cis-prenyltranferase (CPT) là enzyme xúc tác phản ứng trùng ngưng liên tiếp các đơn vị isopentenyl diphosphate (IPP) lên các chất nhận allylic diphosphate để tổng hợp các cisprenyldiphosphate với chiều dài chuỗi khác nhau, từ neryl diphosphate đến cao su thiên nhiên. Ngoài hai trình tự HRT1 (Hevea rubber transferase 1) và HRT2 (Hevea rubber transferase 1) mã hóa cho các cis-prenyltranferase tham gia trong quá trình tổng hợp cao su thiên nhiên đã được phân lập và nghiên cứu, các gene mã hóa các CPT còn lại trong họ enzyme cis-prenyltranferase vẫn chưa được khảo sát chức năng. Kết quả tra cứu ban đầu trên cơ sở dữ liệu hệ phiên mã của cây cao su Hevea brasiliensis bằng phần mềm TBLASTX với trình tự truy vấn HRT2 cho ra 6 "hit" trình tự. Trong số này có một "hit" chứa trình tự mã hóa protein tương đồng 75% với HRT2 và được đặt tên là HbCPT4. Gene HbCPT4 được dự đoán có 3 exon và 2 intron. Trình tự mã hóa (CDS) HbCPT4 được phân lập thành công từ mẫu cDNA của mủ cao su Hevea brasiliensis RRIV 209, được giải trình tự và so sánh với trình tự dự đoán in silico. Trình tự CDS HbCPT4 phân lập từ thực nghiệm và trình tự CDS HbCPT4 được dự đoán in silico khác nhau 7 nucleotide, tuy nhiên hai trình tự polypeptide được suy ra từ hai trình tự CDS này thì hoàn toàn giống nhau. Protein HbCPT4 được dự đoán có 296 amino acid, có trọng lượng phân tử khoảng 34 kDa, pI khoảng 8,19 và chứa 5 vùng bảo tồn (vùng I-V) liên quan đến hoạt tính xúc tác và khả năng liên kết cơ chất của các enzyme họ cis-prenyltransferase (CPT).