En los ecosistemas marinos, la zona eufótica ha sido definida como la capa entre la superficie marina y la profundidad donde penetra el 1% de la irradiancia solar; sin embargo, se ha planteado la necesidad de ampliarla hasta el 0.1%, para incluir comunidades fotoautotrofas adaptadas a bajas irradiancias que aportan significativamente a la productividad. Se realizaron muestreos durante abril, mayo, septiembre y noviembre 2016 en Cuenca Alfonso, en las profundidades de 100, 33, 3 y 0.1 % de penetración de la radiación fotosintéticamente activa, así como otra profundidad estándar de 150 m. Se realizaron lances de CTD y se recolectaron muestras para estimar la concentración de clorofila a y productividad primaria. La capa de mezcla fue menor a los16 m durante abril, mayo y septiembre, incrementando a 48 m durante Noviembre. Las mayores concentraciones de clorofila a se registraron en los estratos de 33 y 3% y en un caso en el nivel de 0.1%. La oncentración de clorofila de la fracción microfitoplanctónica tuvo valores desde indetectables hasta 0.084 mg m-3, mientras que la fracción picofitoplanctónica entre 0.012–0.33 mg m-3. La productividad primaria microfitoplactónica varió entre 0.25–0.41 mg m-3 h-1 (valores puntuales) y 22.39–41.69 mg C m-2 h-1 (valores integrados), mientras que la fracción picofitoplanctónica varió entre 0.25–0.34 mg C m-3 h-1 y 19.92–34.44 mg C m-2 h-1. La concentración de clorofila a fue significativamente mayor en la fracción picofitoplactónica que en la microfitoplanctónica (p<0.05), pero no significativo en productividad primaria (p= 0.05). Concluimos que la profundidad de la zona eufótica influye directamente en la capacidad productiva del ecosistema por lo cual se propone la ampliación de su profundidad al menos al 0.1 % de la irradiancia superficial ya que esto puede significar un incremento de hasta el 30 % en la productividad total.