O presente estudo teve como objetivo avaliar, a qualidade microbiológica de amostras de água da base de piscicultura Carlos Eduardo Matiazze, no município de Presidente Médici, RO, Brasil, através da quantificação de coliformes totais (CT) e termotolerantes (CTT). Os coliformes foram quantificados através do método do Número Mais Provável (NMP)/100mL. Houve grande variabilidade nos resultados, tanto de CT quanto de CTT, ao longo do ano. Os resultados variaram de 300 a 1100000 e 300 a 93000 NMP/100 mL para CT e CTT, respectivamente. As maiores concentrações em NMP/100 mL para CT e CTT ocorreram no ponto 6 e no período chuvoso. Este ponto está localizado a jusante, recebendo toda água dos demais devido ao fluxo de escoamento. Constatou-se que 47,7% das amostras avaliadas para CTT apresentaram valores de NMP/100 mL superiores ao limite máximo estabelecido (1000 NMP/100 mL) pela legislação vigente, Resolução CONAMA, nº. 357/2005. Desta forma, o sistema avaliado é considerado impróprio para o desenvolvimento de atividades destinadas à aquicultura.