2003
DOI: 10.1590/s1415-47572003000400018
|View full text |Cite
|
Sign up to set email alerts
|

Hidden Markov models applied to a subsequence of the Xylella fastidiosa genome

Abstract: Dependencies in DNA sequences are frequently modeled using Markov models. However, Markov chains cannot account for heterogeneity that may be present in different regions of the same DNA sequence. Hidden Markov models are more realistic than Markov models since they allow for the identification of heterogeneous regions of a DNA sequence. In this study we present an application of hidden Markov models to a subsequence of the Xylella fastidiosa DNA data. We found that a three-state model provides a good descript… Show more

Help me understand this report

Search citation statements

Order By: Relevance

Paper Sections

Select...

Citation Types

0
0
0
1

Year Published

2008
2008
2017
2017

Publication Types

Select...
3

Relationship

0
3

Authors

Journals

citations
Cited by 3 publications
(1 citation statement)
references
References 20 publications
0
0
0
1
Order By: Relevance
“…Скрытые марковские модели -инструмент для моделирования информации временнóго ряда. СММ используются во многих совре-менных системах распознавания речи [6], в большинстве приложений вычислительной молекулярной биологии [11], в сжатии информации [12], в системах статистического машинного перевода [7], приложениях компьютерного зрения [13].…”
unclassified
“…Скрытые марковские модели -инструмент для моделирования информации временнóго ряда. СММ используются во многих совре-менных системах распознавания речи [6], в большинстве приложений вычислительной молекулярной биологии [11], в сжатии информации [12], в системах статистического машинного перевода [7], приложениях компьютерного зрения [13].…”
unclassified