Introdução. O cronotipo, ou seja, a preferência de acordar e dormir e as atividades diárias podem influenciar as atividades acadêmicas. Objetivo. Investigar relação do ritmo circadiano (relógio biológico), o turno escolar e o rendimento escolar de adolescentes de escolas públicas do município de Farroupilha/RS. Método. Foi aplicada Escala Matutino/Vespertino (M/V) na sala de aula para estudantes de 6° ano ao 9° ano do Ensino Fundamental e foi utilizado o rendimento escolar curricular dos mesmos. Resultados. A amostra constituiu 478 alunos de cinco escolas públicas do Ensino Fundamental (três municipais e duas estaduais), com média de idade de 12,52; 60% dos alunos eram matutinos e 40% eram vespertinos. Os matutinos que estudavam no turno da manhã apresentaram nota superior aos matutinos que estudavam no turno da tarde em quatro disciplinas, e os vespertinos que estudavam no turno da manhã apresentaram nota superiores em duas das nove disciplinas comparados com os que estudavam no turno da tarde. Conclusão. Os alunos matutinos que estudavam no turno da manhã apresentaram um rendimento escolar superior que os matutinos do turno da tarde, como também os vespertinos em ambos os turnos.