Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide

Abstract

RESUMONeste trabalho, objetivou-se comparar três estimadores do coeficiente de endogamia, F, em uma população diplóide com dois alelos, utilizando-se dados de frequências alélicas em amostras de indíviduos, com diferentes tamanhos obtidas em populações simuladas, por meio do software SAS. Foi avaliado o estimador de F, obtido pela análise de variância de frequências alélicas, o estimador considerando o método dos momentos e o estimador pelo método da máxima verossimilhança. Os resultados encontrados para a média e variância os estimadores, a partir de 1000 estimativas de F, calculadas para cada tamanho de amostra, mostraram que os três estimadores são tendenciosos. Entretanto, de maneira geral, observou-se que o estimador considerando a análise de variância foi menos tendencioso e apresentou menor variância, quando o coeficiente de endogamia da população foi alto. Para tamanho de amostra superior a 50, os três estimadores tiveram comportamento semelhante, independente da frequência alélica e da endogamia da população. Termos para indexação:Método dos momentos, método da máxima verossimilhança, análise de variância de freqüências alélicas, tamanho amostral, viés, coeficiente de endogamia. ABSTRACTThe present work evaluated the properties of three estimators of the inbreeding coefficient, F, in a diploid population with two alleles, using data of gene frequencies in individuals from random samples obtained from populations simulated through the SAS. We evaluated the estimators of F obtained by variance analysis of allelic frequencies, obtained by moment method, and estimator obtained by maximum likelihood method. The analysis of the means and variances of the estimators, obtained from 1000 estimates of F, calculated for each sample size, demonstrated that the three estimators were biased. However, it was observed that the estimator obtained from univariate analysis was less biased and presented smaller variance, when the inbreeding coefficient in the population was elevated, while for populations with low inbreeding, the variance of the estimator obtained by the multivariate analysis was smaller.

Comparação bayesiana de modelos com uma aplicação para o equilíbrio de Hardy-Weinberg usando o coeficiente de desequilíbrio

“…Portanto, o coeficiente de desequilíbrio mede estas discrepâncias entre as proporções genotípicas sob cruzamentos aleatórios e estas sob cruzamentos endogâmicos na população (WEIR, 1996). A endogamia é definida como um sistema em que os acasalamentos se dão entre indivíduos aparentados, ou seja, relacionados pela ascendência, afetando diretamente a diversidade genética da população (MUNIZ et al, 2008;MUNIZ et al, 2010).…”