Prebiotic chemical kinetics imprint on positional codon usage

Abstract

Foram analisados mais de um milhão de exons pertecentes aos 3 domínios da vida, Eubacteria, Archea e Eukarya. Um número significante de primeiros codons com um excesso de bases idênticas nas suas duas primeiras posições foi encontrado nos genomas das Eubacterias e Archea. Este excesso tem uma freqüência muito menor nos genomas das Eukarya. Propõe-se que esta discrepância depende da cinética de crescimento dos oligoribotídeos na Terra primitiva, que foi diminuindo com o passar do tempo.Over one million exons across the three Domains of Life have been analyzed and a significant excess of first codons containing identical bases in their first two positions has been found in Eubacteria and Archaea genomes. This frequency is observed to be much lower in the genome of Eukarya. This discrepancy is proposed to depend on the kinetics of oligoribotide/oligoribotide-like growth in the primeval Earth, toned down during further evolution.