Importance of the solvation degree of peptide-resin beads for amine groups determination by the picric acid method

Abstract

O clássico e importante método do ácido pícrico, usado nas áreas de bioquímica e química de polímeros para a quantificação de grupos aminos, foi escolhido neste trabalho como modelo para investigar a importância do grau de solvatação de grãos poliméricos durante o protocolo analítico. Verificou-se que este método, proposto há cerca de três décadas atrás, falha na quantificação de grupos amino de peptidil-resinas contendo seqüência agregante e polar. Isto ocorre devido à solvatação insuficiente dos grãos quando apenas o CH 2 Cl 2 é utilizado na etapa de ligação do ânion picrato e na subsequente etapa de lavagem. Demonstrou-se que a utilização nestas etapas, de soluções de CH 2 Cl 2 /DMF (dimetilformamida) e de CH 2 Cl 2 /EtOH permite uma determinação correta dos grupos amínicos de peptídil-resinas. Além da importância em si para o método da síntese de peptídeos em fase sólida, estes resultados representam também a primeira comprovação experimental da correlação quantitativa existente entre o grau de solvatação e a eficiência de um método analítico efetuado em grãos de resinas.The classic and important picric acid method used in polymers biochemical and chemical fields of polymers for amine group quantification was chosen in this work as a model for evaluating the influence of the resin bead solvation during an analytical procedure. It was observed that this method, proposed almost three decades ago, failed to quantify amine groups of peptidyl-resin containing aggregating and polar sequence. This was due to inefficient solvation of resin beads when only CH 2 Cl 2 was used for picrate anion binding and subsequent washing steps. It was demonstrated that the use of CH 2 Cl 2 /DMF (dimethylformamide) and CH 2 Cl 2 /EtOH solutions during these steps allows correct determination of peptidyl-resin amine groups. Besides the importance for the solid phase peptide synthesis methodology itself, these findings also represent the first quantitative demonstration of the relationship between solvation degree and the efficiency of a polymer-supported analytical method.

Preclinical evaluation of [18F]FB-A20FMDV2 as a selective marker for measuring αVβ6 integrin occupancy using positron emission tomography in rodent lung

“…This cartridge/valve assembly was then placed directly over a magnetic stirrer. To allow good reagent penetration and enhance the yield and efficiency of coupling, the resin beads were pre-swelled in a small volume of solvent during the set-up procedure [27,36].…”

Produção de peptídeos: aprimoramento da síntese em polímeros através do uso da ressonância paramagnética eletrônica (RPE)

“…Melhor resultado se observa com o solvente que proporcionou mais inchamento dos grãos (20% DMSO/NMP), se comparado ao clássico DMF, bastante empregado na SPFS. Esses dados corroboram definitivamente que há uma relação direta entre o grau de solvatação e a eficiência de reações químicas dentro do grão de resinas, como descrito previamente 43,52,53 . Os dados apresentados nessa tabela fizeram parte especificamente de estudos desenvolvidos anteriormente 46 .…”

Study of the effect of the peptide loading and solvent system in SPPS by HRMAS-NMR

“…Thus, ING, AIDYING and VQAAIDYING segments assembled in the 3.0 mmol/g BHAR were labelled at their N -terminal portion with the Fmoc-TOAC amino acid-type probe [31], as previously described in the literature [8,9]. In order to avoid a spin-spin exchange interaction which broadens the EPR lines [42], the paramagnetic labelling was kept as low as possible [8,9] and quantified by the modified picric acid methodology [43] before and after coupling the Fmoc-TOAC spin label. Moreover, the low labelling protocol allows the physicochemical and steric perturbations due to the introduction of the spin probe to be kept to a minimum, decreasing their influence on the solvation characteristics of the peptidyl-resin under investigation.…”