Genetic variability among Commelina weed species from the states of Paraná and São Paulo, Brazil

Abstract

-This work aims to carry out a comparative analysis using RAPD molecular markers in four Commelina weed species from the state of Paraná and C. benghalensis populations from the states of Paraná and São Paulo, Brazil. The genomic plant DNA sample was extracted from the leaves, separated, randomly fragmented and amplified by PCR. Random amplified polymorphic DNA fragments (RAPD markers) were analyzed by using POPGENE statistical program. Eighty-five primer sequences were tested but only three were suitable as molecular markers producing 37 DNA polymorphic fragments for comparisons among four Commelina species and 22 polymorphic fragments for comparisons among C. benghalensis populations. The results showed that there were inter-specific and intra-specific genetic variabilities among Commelina plant genera. Genetic diversity analysis between species indicated four mono-specific clusters and it was suggested to keep C. villosa as one species. Regarding the intra-specific genetic variability of C. benghalensis alone, three groups were verified, although there were 13 populations from two geographical areas. However, these clusters do not correspond to the distinct characteristics verified.Keywords: biotype, Commelinaceae, molecular markers, weeds.RESUMO -O presente trabalho procurou analisar a variabilidade genética, utilizando-se de marcadores RAPD, comparando quatro espécies de Commelina procedentes do Estado do Paraná e entre populações de C. benghalensis procedentes dos Estados do Paraná e São Paulo. Foi amostrado o DNA genômico extraído das folhas, o qual foi separado, fragmentado aleatoriamente e amplificado por PCR. Os fragmentos polimórficos de DNA (marcadores RAPD) foram analisados pelo programa estatístico POPGENE. Oitenta e cinco primers foram testados, mas somente três sequências foram consideradas marcadores moleculares, produzindo 37 bandas de DNA polimórfico para comparação entre as quatro espécies de Commelina e outras 22 para comparação entre as populações de C. benghalensis. Os resultados mostraram que há variabilidade genética inter e intraespecífica nas plantas do gênero Commelina. A análise da diversidade genética entre as espécies indicou quatro agrupamentos monoespecíficos, e isso sugere manter C. villosa como uma espécie. Considerando a variabilidade genética intraespecífica somente de C. benghalensis, apesar das 13 populações provenientes de dois Estados geográficos, três grupos foram identificados. Entretanto, esses agrupamentos não correspondem às características morfológicas distintas observadas.Palavras-chave: biótipo, Commelinaceae, marcadores moleculares, planta daninha.

Resposta de diferentes populações de Digitaria insularis ao herbicida glyphosate

“…A variabilidade genética das populações de plantas daninhas é afetada por inúmeros fatores evolutivos, como o sistema de produção, a interação entre a cultura e a planta daninha (fluxo gênico através da dispersão do pólen e da semente), a distribuição geográfica e a seleção natural (Huangfu et al, 2009). Pesquisas sobre diversidade genética das plantas cultivadas têm sido desenvolvidas para espécies, variedades, cultivares e caracterização de biótipos, porém poucos estudos têm sido feitos com plantas daninhas (Rocha et al, 2009). O conhecimento se a diversidade genética da planta daninha é a mesma entre populações diferentes -especialmente entre aquelas sujeitas à seleção ocasionada pelo uso repetitivo de herbicidas e outra sem histórico de aplicação -é necessário (Huangfu et al, 2009 Para as populações de Rio Verde e Campo Florido, a complementação de glyphosate com diuron + paraquat ou a sua associação com fluazifop não agregou vantagens, pois para esses indivíduos a aplicação única de 1,5 kg ha -1 de glyphosate resultou em excelente controle das plantas.…”

GENETIC VARIABILITY OF Rottboellia cochinchinensis POPULATIONS IN SUGARCANE FIELDS

“…The AFLP technique has been employed to evaluate the genetic diversity of several species of plants, among which are Amaranthus palmeri (Chandi et al, 2013) and Veronica hederifolia (Wu et al, 2010). Rocha et al (2009) studied the genetic variability of four species of Commelina with RAPD, and Alves et al (2003), using the RAPD marker, identified and characterized different populations of Rottboellia cochinchinensis.…”

Monitoramento da resistência a herbicidas inibidores da EPSPs e genômica populacional de >i<Digitaria insularis>/i< nas principais regiões produtoras de soja no Brasil

“…Pesquisas sobre diversidade genética das plantas cultivadas têm sido desenvolvidas para espécies, variedades, cultivares e caracterização de biótipos, porém poucos estudos têm sido feitos com plantas daninhas (ROCHA et al, 2009). O conhecimento se a diversidade genética da planta daninha é a mesma entre populações diferentes -especialmente entre aquelas sujeitas à seleção ocasionada pelo uso repetitivo de herbicidas e outra sem histórico de aplicação -é necessário (HUANGFU; SONG; QIANG, 2009).…”