Development of a Real-time PCR test for porcine group A rotavirus diagnosis

Abstract

INTRODUCTIONGroup A rotavirus (RVA) is one of the main causative agents of diarrhea in a variety of animal species, as reported in several countries (Estes & Kapikian 2007). RVA infection is common in swine farms, and it results in decreased growth performance, increased mortality and economic loss (Papp et al. 2013).RVA belongs to Family Reoviridae, Subfamily Sedoreovirinae, Genus Rotavirus, and its genome consists of 11 double-stranded RNA (dsRNA) segments, coding for 6 structural (VP1, VP2, VP3, VP4, VP6, VP7) and 6 non-structural proteins (NSP1 through 6) (King et al. 2012).Diagnosis of RVA infection plays a central role in establishing measures for control and prevention. The methods currently available, the polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) technique (Herring et al. 1982) allows the detection of all rotavirus strains regardless of the group to which The results also demonstrated high intra-and inter-assay reproducibility (coefficient of variation ≤1.42%); thus, this method proved to be a fast and sensitive approach for the diagnosis of RVA in pigs.

<b>Análise multigênica de rotavírus do grupo A em suínos</b>

“…Em humanos, os rotavírus foram inicialmente descritos por Bishop et al (1973) No Brasil, os RVA foram descritos pela primeira vez durante as investigações de quadros de diarreia em crianças no Pará (LINHARES et al, 1977). Desde então, inúmeros outros estudos deram início no país e em nível internacional, abrangendo aspectos desde os primeiros achados por microscopia eletrônica até a caracterização molecular das cepas circulantes em humanos e animais, atestando a importância e a relevância dos rotavírus na etiologia das diarreias em diversas espécies de mamíferos e de aves (ASANO et al, 2010;DHIMAN et al, 2015;MARCONI et al, 2015 Os rotavírus apresentam especificidades antigênicas de grupo, subgrupo e sorotipo, permitindo a classificação de múltiplos grupos (ou sorogrupos) e a existência de múltiplos sorotipos dentro de cada grupo (ESTES; GREENBERG, 2013). Assim, baseado nas propriedades antigênicas e sequências nucleotídicas da proteína viral do capsídeo interno (VP6), os rotavírus são divididos em 7 sorogrupos altamente diversos geneticamente e denominados de A a H (ATTOUI et al, 2011).…”