Caracterização molecular através da técnica fAFLP de isolados de Diaporthe citri

Abstract

Citriculture is a market in expansion specially in Sao Paulo State, whose importance in the economy is already recognized. Like any other cultivated species, the increase of planted areas contributes to an increase in disease problems. Thus, many diseases affect citrus species, including melanose, caused by Diaporthe citri (Wolf.), to which most commercial varieties are susceptible to the disease. Knowledge of the intra-specific diversity is important when selecting varieties for resistance. This study evaluated the genetic variability among Diaporthe citri isolates, obtained from different geographical regions, varieties, and parts of the plant using molecular markers. Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) markers were used to characterize ten isolates of this pathogen. Genomic DNAs extracted from mycelial mass were used in amplification reactions. fAFLP allowed separation of the isolates into four distinct groups. However, genetic similarity analysis did not group isolates by location, variety or part of the plant.Additional keywords: melanose, polymorphism, genetic variability, citrus.A melanose, causada por Diaporthe citri (Wolf.), fase anamórfica Phomopsis citri, ocasiona em certos períodos perdas econômicas financeiras significativas, principalmente em frutos muito manchados, resultando em perda ou queda na produção de suco cítrico (3,11,15,16).Os sintomas da doença estão presentes em folhas, ramos e Caracterização molecular através da técnica fAFLP de isolados de Diaporthe citri A citricultura é um mercado em expansão, principalmente no Estado de São Paulo, cuja importância na balança comercial já é reconhecida. Como em qualquer espécie cultivada, o crescimento das áreas de cultivo favorecem também o crescimento de problemas fitossanitári-os. Desta forma, as espécies de citros são afetadas por diversas doenças destacando-se entre elas a melanose, causada por Diaporthe citri (Wolf.), à qual a grande maioria das variedades comerciais são suscetí-veis. O conhecimento da diversidade intra-específica é de grande importância, já que esta poderá auxiliar na seleção de variedades com resistência. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade gené-tica em isolados de Diaporthe citri, originários de diferentes locais, variedades e partes da planta, utilizando marcadores moleculares. Marcadores do tipo AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) foram utilizados para caracterização de dez isolados do pató-geno. Os DNAs genômicos extraídos da massa micelial foram utilizados nas reações de amplificação. A técnica fluorescent AFLP permitiu a distinção dos isolados estudados, tendo sido classificados em quatro grupos distintos. Contudo, estes grupos não foram formados em razão da região geográfica, parte da planta ou variedade.frutos. Nas folhas, as lesões inicialmente são de tamanhos menores, com coloração de marrom-escura a pretas. Sintomas em ramos novos e verdes são aparentemente similares aos da folha, com exceção de serem menores e menos salientes. Em frutos, as lesões iniciais são mancha...

Genetic Diversity of Isolates of Macrophomina phaseolina Associated with Cowpea from Brazil Semi-Arid Region

“…Several efforts have been made to divide the isolates of M. phaseolina into subspecies or subgroups; however, this has been difficult due to extreme variation intraspecific in morphology and pathogenicity. Access to genetic variability of fungi allows evaluating intra and interspecific phylogenetic relationships, the identification of races and pathogenic isolates and can be done using molecular markers, which can be used as an auxiliary tool to classical taxonomy and in the disease control strategies (Nozaki et al, 2006). Molecular approaches based on sequence analysis of nucleic acids has been used with success in the characterization of M. phaseolina (Jana et al, 2003;Sarr et al, 2014;Leyva-Mir et al, 2015;Salahlou et al, 2016).…”