Modelo autologístico espaço-temporal com aplicação à análise de padrões espaciais da leprose-dos-citros

Abstract

Resumo -O objetivo deste trabalho foi propor estratégias de modelagem aplicadas aos dados de incidência de leprose-dos-citros, por meio do uso de um modelo autologístico espaço-temporal. A adequação do modelo autologístico foi avaliada quanto à: análise de dados provenientes de avaliações feitas em diferentes momentos; detecção de padrões espaciais da doença, pela avaliação de diferentes estruturas de vizinhança; consideração do efeito defasado no tempo de covariáveis de vizinhança; e ao efeito do ácaro transmissor na probabilidade de nova infecção. O modelo autologístico espaço-temporal adotado estendeu o modelo logístico usual, em que a estrutura de vizinhança é descrita por meio da construção de covariáveis, a partir da resposta observada em plantas vizinhas à planta avaliada, na mesma avaliação, ou em avaliações anteriores. Os dados de incidência de leprose nas plantas de citros foram coletados em pontos referenciados no espaço, durante aproximadamente dois anos. Os modelos detectam o efeito da presença do vetor e os padrões espaciais na ocorrência de novas infecções, tanto para covariáveis de vizinhança da mesma avaliação, quanto para covariáveis de vizinhança da avaliação anterior. Além disso, os modelos considerados permitem quantificar as variações na probabilidade de ocorrência da doença de acordo com o estado da doença e com a incidência do ácaro transmissor. Termos para indexação: Brevipalpus phoenicis, Citrus leprosis virus, Citrus sinensis, estatística espacial, estruturas de vizinhança, pseudo-verossimilhança. Spatial temporal autologistic model with an application to the analysis of spatial patterns of citrus leprosisAbstract -The goal of this study was to propose modeling strategies applied to the analysis of citrus leprosis incidence, through the use of a spatial temporal autologistic model. We evaluated the adequacy of autologistic model to consider data collected at different times; to detect spatial-temporal patterns through different neighboring structures; to consider the effect of covariates from previous times; and assessing the effect of the presence of the disease vector in the probability of new infections occurrence. The spatial temporal autologistic model adopted has extended the usual logistic model, in which the neighboring structures is described by means of covariates built from the status of plants nearby, at the same or at previous times. Data regarding the presence of the leprosis on plants were collected at field points referenced in space, over a period of approximately two years. Models detect the presence of spatial patterns on new infections for the studied neighboring structures, at the same or previous time. Additionally, probability estimates of a plant become infected can be obtained from the fitted models, given the occurrence of the disease and vector.

Space–time variability of citrus leprosis as strategic planning for crop management

“…Moreover, our results have also confirmed high dependence among symptomatic plants, corroborating the findings of other authors . Plants with high scores for leprosis severity were always surrounded by low‐scored trees.…”

“…Moreover, our results have also confirmed high dependence among symptomatic plants, corroborating the findings of other authors. 1,[13][14][15] Plants with high scores for leprosis severity were always surrounded by low-scored trees. An exponential variation was found for the data by variogram modeling; thus, severity scores varied slightly but at short distances.…”

“…However, the lack of a correlation between disease incidence and the presence of mites in plants is one of the challenges for the citrus leprosis pathosystem . Therefore, a few studies have suggested that the decision to control mites should consider not only its presence, but also the disease occurrence …”

“…13 Therefore, a few studies have suggested that the decision to control mites should consider not only its presence, but also the disease occurrence. 14,15 This study aimed to evaluate space and time variability in leprosis in citrus orchards sprayed against the mite-vector (Brevipalpus spp.). We believe that sampling plans based on spatiotemporal variations in both leprosis-affected plants and viruliferous mites may improve management of this disease in the field, in addition to determining when and where the control should be applied accurately.…”

Dinâmica da infestação de Brevipalpus phoenicis (Geijskes, 1939) (Acari:Tenuipalpidae) em pomares cítricos da Bahia, Brasil

“…Os estudos acerca dos ácaros Brevipalpus phoenicis (Geijskes,1939) (Acari: Tenuipalpidae) habitualmente têm como cenário as paisagens citrícolas com registro de ocorrência do Vírus da Leprose dos Citros -VLCi. Esse é o caso, por exemplo, da investigação do padrão espacial do ácaro em pomares de São Paulo (BASSANEZI; LA-RANJEIRA, 2007), do desenvolvimento de modelos de disseminação da leprose baseados na presença do ácaro (FRANCISCON et al, 2008) e de mecanismos de dispersão de B. phoenicis (ALVES et al, 2005). Assim, considerando-se a importância socioeconô-mica da citricultura do RB, a máxima prevalência do ácaro B. phoenicis naquela região (SILVA et al, 2009) e a ocorrência de leprose dos citros no parque citrícola do LN, este trabalho objetivou: em ambas as regiões baianas (RB e LN) (i) quantificar a proporção de plantas e frutos com infestação por B. phoenicis; (ii) caracterizar o padrão espacial de infestação do vetor do VLCi, e (iii) descrever a dinâmica temporal da infestação.…”