Marcadores fAFLP na caracterização de três genótipos de umezeiro selecionados como porta-enxertos para pessegueiro

Wickert, Ester; Lemos, Eliana Gertrudes de Macedo; Pereira, Fernando Mendes; Mayer, Newton Alex

doi:10.1590/s0100-204x2007001200011

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“…In a research on fAFLP markers concerning the characterization of three mume genotypes selected as rootstocks for peach trees, using 24 primer combinations, Wickert et al (2007) obtained 272 molecular markers, which differed between the three mume genotypes, from a total of 648 markers, thereby yielding an average of 27 bands per primer combination. Santos et al (2008), analyzing the genetic variability of the umbu fruit tree in a semi-arid area of Brazil, with an average of 14.2 bands per primer combination, obtained 141 and 58 polymorphic and monomorphic bands, respectively, using AFLP and 14 combinations of EcoR1/Mse1 primers (IC).…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

Genetic characterization of fig tree mutants with molecular markers

Rodrigues¹,

Martins²,

Desidério³

et al. 2012

Genet. Mol. Res.

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ABSTRACT. The fig (Ficus caricaL.) is a fruit tree of great world importance and, therefore, the genetic improvement becomes an important field of research for better crops, being necessary to gather information on this species, mainly regarding its genetic variability so that appropriate propagation projects and management are made. The improvement programs of fig trees using conventional procedures in order to obtain new cultivars are rare in many countries, such as Brazil, especially due to the little genetic variability and to the difficulties in obtaining plants from gamete fusion once the wasp Blastophaga psenes, responsible for the natural pollinating, is not found in Brazil. In this way, the mutagenic genetic improvement becomes a solution of it. For this reason, in an experiment conducted earlier, fig plants formed by cuttings treated with gamma ray were selected based on their agronomic characteristics of interest. We determined the genetic variability in these fig tree selections, using RAPD and AFLP molecular markers, comparing them to each other and to the Roxo-de-Valinhos, used as the standard. For the reactions of Techniques that can detect polymorphism between treatments, such as DNA sequencing, must be tested. The phenotypic variation of plants may be due to epigenetic variation, necessitating the use of techniques with methylation-sensitive restriction enzymes.

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Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

Genetic characterization of fig tree mutants with molecular markers

Rodrigues¹,

Martins²,

Desidério³

et al. 2012

Genet. Mol. Res.

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“…O DNA foi extraído a partir de 50 mg de folhas frescas completamente expandidas, por meio do protocolo descrito por Doyle & Doyle (1991 (Cipriani et al, 1999)] e da série BPPCT [BPPCT 001, BPPCT 002, BPPCT 016, BPPCT 023, BPPCT 026, BPPCT 034 e BPPCT 041 (Dirlewanger et al, 2002)], além de iniciadores para locos STS [OPAP4 (Yamamoto & Hayashi, 2002)] e SCAR [SCAL 19 (Lecouls et al, 1999)]. …”

Section: Methodsunclassified

“…Embora no Brasil o registro de cultivares não exija caracterização molecular, em outros países com sistemas de certificação de material vegetal consolidados, as técnicas moleculares têm permitido elaborar um tipo de impressão digital molecular da planta ("fingerprinting" varietal), o que facilita o controle de qualidade em qualquer etapa do processo produtivo (Bianchi et al, 2004a;Wickert et al, 2007). Bianchi et al (2004b) verificaram problemas de identificação inter e intravarietal de porta-enxertos de pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch], no Banco de Germoplasma da Universidade Federal de Pelotas (UFPel), o que reforça a necessidade de comprovação da origem genética do material presente nesses bancos.…”

Section: Introductionunclassified

Caracterização molecular e variabilidade genética entre porta-enxertos de pessegueiro com base em marcadores codominantes

Paula

Bianchi²,

Fachinello

2012

Pesq. agropec. bras.

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Resumo -O objetivo deste trabalho foi estabelecer um padrão para a caracterização molecular e a diferenciação de porta-enxertos de pessegueiro, bem como estimar parâmetros de variabilidade genética com base em marcadores codominantes. Catorze genótipos foram avaliados com uso de iniciadores para locos microssatélites das séries BPPCT e UDP, e para locos STS e SCAR. O perfil eletroforético foi registrado quanto à presença ou à ausência de bandas, as quais foram usadas para calcular a similaridade genética entre cultivares, por meio do coeficiente "simple matching", e para a análise de agrupamento de cultivares, pelo método das médias aritméticas não ponderadas (UPGMA). Foram calculados: número de alelos por loco, frequências alélicas, heterozigosidade esperada e observada, endogamia e conteúdo de informação polimórfica (PIC). Os 18 locos avaliados produziram 82 polimorfismos e permitiram elaborar um dendrograma que discriminou os genótipos em três grupos principais. A heterozigosidade esperada e observada nos 18 locos SSR foi de 0,66 e 0,22, respectivamente. Valores máximos para endogamia (1,0) foram identificados nos locos UDP 98407, UDP 98412, BPPCT 034, BPPCT 016, SCAR-SCAL 19 e STS OPAP4. O PIC variou de 0,81, para SCAR-SCAL 19, a 0,46, para UDP 98407. O polimorfismo dos 18 marcadores possibilita obter acurada relação genética entre os genótipos de pessegueiro avaliados e identificar os mais contrastantes para uso em programas de melhoramento. Termos de indexação: Prunus persica, distância genética, frequência alélica, genética molecular, seleção de parentais. Molecular characterization and genetic variability among peach rootstocks based on codominant markersAbstract -The objective of this work was to establish a standard for molecular characterization and differentiation of peach rootstocks, as well to estimate genetic variability parameters based on codominant markers. Fourteen genotypes were evaluated using primers for microsatellite loci from the BPPCT and UDP series and for the STS and SCAR loci. The electrophoretic profile was recorded for the presence or absence of bands, which were used to calculate the genetic similarity among cultivars by the simple matching coefficient, and to perform cluster analysis by the unweighted arithmetic average (UPGMA) method. The number of alleles per locus, allele frequencies, observed and expected heterozygosity, inbreeding, and polymorphic information content (PIC) were calculated. The 18 loci produced 82 polymorphisms, allowing for the elaboration of a dendrogram, which discriminated the genotypes into three main groups. Observed and expected heterozygosity in the 18 SSR loci were 0.66 and 0.22, respectively. Maximum values for inbreeding (1.0) were identified in loci UDP 98407, UDP 98412, BPPCT 034, BPPCT 016, SCAR-SCAL 19, and STS OPAP4. PIC ranged from 0.81 for SCAR-SCAL 19, to 0.46 for UDP 98407. The polymorphism of the 18 markers allows for an accurate genetic relationship among the evaluated peach genotypes and the identification of the more contrasting ones f...

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Técnicas moleculares para caracterização e conservação de plantas medicinais e aromáticas: uma revisão

Souza

2015

Rev. bras. plantas med.

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RESUMO Os estudos que visam à caracterização e conservação de germoplasma de espécies de plantas medicinais e aromáticas vêm crescendo de forma expressiva frente ao potencial econômico dessas espécies. Para tanto, diferentes marcadores moleculares estão disponíveis no mercado, e a seleção de um ou mais marcadores requer o conhecimento de suas propriedades e aplicações. Este trabalho tem por objetivo apresentar uma revisão bibliográfica sobre as principais técnicas moleculares utilizadas nesses estudos.

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Marcadores fAFLP na caracterização de três genótipos de umezeiro selecionados como porta-enxertos para pessegueiro

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Genetic characterization of fig tree mutants with molecular markers

Genetic characterization of fig tree mutants with molecular markers

Caracterização molecular e variabilidade genética entre porta-enxertos de pessegueiro com base em marcadores codominantes

Técnicas moleculares para caracterização e conservação de plantas medicinais e aromáticas: uma revisão

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