Introdução: o avanço da terapia antirretroviral (TARV) foi importante para a longevidade e qualidade de vida do paciente infectado pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV). Objetivo: analisar a associação do tempo de uso da TARV e do nível de atividade física na composição corporal e lipodistrofia de pacientes infectados pelo HIV. Método: A amostra foi composta por 219 pacientes infectados pelo HIV distribuídos em dois grupos: G1 (tratados com TARV por até 12 meses; n=85) e G2 (tratados com TARV por mais que 12 meses; n=134). Os pacientes foram avaliados quanto às suas características sociodemográficas, clínicas, composição corporal, nível de atividade física e lipodistrofia. Os dados foram analisados por estatística descritiva e inferencial, por meio dos programas Graphpad Prism e BioEstat 5.0, adotando-se o p<0.05. Resultados: encontrou-se maior frequência para homens, escolaridade de 12 anos ou mais, pardos e renda de 1-2 salários, tanto no G1 como G2. A faixa etária predominante para G1 foi de 18 a 37 anos (75%) e para G2 de 28 a 47 anos (64%). Pacientes com diagnóstico de Aids no G2 foi maior (66% vs 28%), bem como, para o uso de inibidor de protease (IP; 37% vs 14%). A lipodistrofia estava presente em 34% da amostra (G1-18%; G2-44%), sendo o tipo predominante no G1 a lipoatrofia (47%) e no G2 a mista (51%). Em ambos os grupos predominou a inatividade física (G1-70%; G2-66%). Conclusão: a inatividade física foi elevada nos dois grupos, contudo, o G2 obteve maior frequência para pacientes com Aids, lipodistrofia e uso de IP. Além disso, o G2 apresentou associação para a presença de Aids, da lipodistrofia e para o uso de inibidor de protease. Já o nível de atividade física não apresentou associação com índice de massa corporal, circunferência abdominal, percentual de gordura, lipodistrofia, situação de imunodeficiência e com o uso de IP.