Objetivo: Caracterizar e comparar o desempenho em habilidades de processamento fonológico de escolares na alfabetização. Métodos: A amostra foi composta por 40 escolares, do 1º ano do ensino fundamental, divididos em: Grupo I (GI): 20 escolares sem dificuldades na alfabetização, e Grupo II (GII): 20 escolares com dificuldades na alfabetização. Para a avaliação foram utilizadas provas do processamento auditivo, consciência fonológica e nomeação automática rápida. Resultados: Na comparação dos desempenhos, os escolares de GII apresentaram média inferior a GI. Na análise da mediana ambos os grupos apresentaram desempenho similar, mas GII persiste com desempenho inferior a GI. Conclusão: Os escolares com dificuldades na alfabetização apresentam desempenho deficitário em provas que avaliam o processamento fonológico, quando comparados aos escolares sem dificuldades. O baixo desempenho nessas habilidades identificado na alfabetização, possibilita a realização de estratégias de intervenção que potencializem a aprendizagem, minimizando o fracasso escolar.