O objetivo deste estudo transversal foi determinar a prevalência da brucelose em bovinos e bubalinos e identificar seus principais fatores de risco. Foram estudadas fêmeas adultas provenientes de municípios da Amazônia, no estado do Maranhão, Brasil. As coletas foram realizadas em propriedades rurais (G1) e em abatedouros (G2), sem serviço de inspeção, localizados nos municípios de Pinheiro-MA, Santa Helena-MA e Turilândia-MA. Foram realizadas entrevistas com produtores rurais e as questões relacionadas ao manejo e às condições ambientais foram utilizadas como variáveis preditoras. O diagnóstico foi realizado pelo teste sorológico de antígeno acidificado tamponado (AAT). Na análise dos dados, utilizou-se regressão logística aferida com curva ROC. Foram examinados 491 animais provenientes de 62 propriedades. Os resultados apontaram 25 animais positivos, uma prevalência de 5,1%. Não houve diferenças estatísticas nas ocorrências entre os grupos G1 e G2, nem entre municípios ou entre as espécies. Os fatores de risco associados à infecção foram: aquisição de animais (RC=3,27); histórico de aborto (RC=3,13) e tamanho do rebanho maior que 57 cabeças (RC=4,64). O modelo final apresentou bom ajuste (AUC = 0,749, IC = 0,645 a 0,853) na previsão de novas infecções. As estratégias de combate à doença devem envolver controle de trânsito animal, elevação da cobertura vacinal, e identificação e eliminação dos animais reagentes.