Differential admixture in Latin American populations and its impact on the study of colorectal cancer

Colistro, Valentina; Mut, Patricia; Hidalgo, Pedro; Carracedo, Ángel; Quintela, Inés; Rojas-Martı́nez, Augusto; Sans, Mónica

doi:10.1590/1678-4685-gmb-2020-0143

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“…14 La ancestría individual se evaluó utilizando el programa ADMIXTURE versión 1.3.1, 15 usando un subconjunto de 31 000 SNP del microarreglo Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0, con una muestra de 1712 sujetos (831 casos y 881 controles). 8 Se establecieron tres poblaciones ancestrales para el análisis de la población mexicana. 16 Estos análisis incluyeron muestras de ascendencia europea y africana de HAPMAP, 17 así como muestras de nativos americanos.…”

Section: Abstract: Colorectal Cancer Association Study Mexico Single-...unclassified

“…6,7 Es importante comprender los efectos de estos SNP en CCR en poblaciones latinoamericanas. 8 Realizamos un estudio de casos y controles de sujetos de tres ciudades mexicanas para analizar las asociaciones entre CCR y las variantes rs12953717, rs4939827, rs11874392, rs961253, rs4779584, rs11632715 y rs4444235, seleccionadas después de revisar los SNP relacionados con CCR en estudios de asociación del genoma completo en población española, debido a la contribución de este componente étnico en la población mexicana. 7,[9][10][11][12]…”

Section: Introductionunclassified

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Cáncer colorrectal. Variantes génicas en la vía de señalización BMP y ancestría en población mexicana

Haro-Santa-Cruz¹,

Colistro²,

Cárdenas-Cadena³

et al. 2022

GMM

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Introducción: Variantes génicas relacionadas con la vía de señalización de las proteínas morfogenéticas óseas (BMP2, BMP4, GREM1, SMAD7) se han asociado a cáncer colorrectal, principalmente en poblaciones caucásicas. Objetivo: Describir la asociación de variantes en miembros de la vía BMP en población mexicana, caracterizada por su ancestría indoamericana y caucásica. Métodos: Se realizó el genotipado de 1000 casos de cáncer colorrectal y 1043 individuos de control reclutados en la Ciudad de México, Monterrey y Torreón mediante la plataforma Sequenom. Con análisis univariados y multivariados se estudiaron las asociaciones entre cáncer colorrectal y variantes. Resultados: Las variantes rs4444235, rs12953717 y rs4939827 replicaron la asociación con la neoplasia (p ≤ 0.05). La ascendencia caucásica mostró asociación con el tumor. Conclusiones. El estudio mostró las asociaciones entre cáncer colorrectal y las variantes SMAD7 y BMP4, así como con el componente caucásico de la mezcla étnica.

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Section: Abstract: Colorectal Cancer Association Study Mexico Single-...unclassified

Section: Introductionunclassified

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Colistro²,

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