Nos últimos anos a cultura do milho assumiu grande importância na economia nacional, levando os produtores a adotarem algumas práticas de manejo, como cultivos sucessivos, que resultam no aumento de problemas fitossanitários, como as doenças de colmo e que reduzem a produtividade. O objetivo deste trabalho foi verificar os efeitos das aplicações de dois fungicidas em estádios fenológicos do milho para controle da podridão da base do colmo e seus efeitos nas variáveis agronômicas. O experimento foi conduzido em Toledo – PR, durante a segunda safra (safrinha) de 2021. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados no esquema fatorial 5 x 2, com cinco repetições. O primeiro fator refere-se aos estádios fenológicos de aplicação dos fungicidas (V4, V8, V4+V8 e V4+V8+V12, além de testemunha não tratada) e o segundo fator refere-se aos fungicidas (trifloxistrobina + protioconazol e piraclostrobina + fluxapiroxade). Avaliou-se altura de planta, altura de inserção de espiga, diâmetro de colmo, número de grãos por fileira, massa de mil grãos, produtividade e a incidência da podridão da base do colmo. Com base nos estádios fenológicos de aplicação dos fungicidas só houve diferença estatística para altura de planta e incidência de podridão da base do colmo. No estádio V4, a altura de planta constatada superou a testemunha e o estádio V4 + V8, com diferenças de 4,8 e 4,0%, respectivamente. Em relação aos fungicidas só foi verificada na altura de planta e produtividade. Os fungicidas foram mais eficazes para controlar a podridão da base do colmo do milho, quando aplicado nos estádios vegetativos V4 + V8 + V12. As variáveis agronômicas número de grãos por fileira e massa de mil grãos não foram influenciadas pela aplicação dos fungicidas. Com a aplicação de piraclostrobina + fluxapiroxade a produtividade foi 7% maior em relação a aplicação de trifloxistrobina + protioconazol.