It is presumed that antiproliferative activity of anthocyanidin has interaction with Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) which has effect on lung cancer cell growth. This study aimed to observe the interaction between anthocyanidin and EGFR and to find out prediction, absorption, distribution activities as well as anthocyanidin toxicity compared to Gefitinib, an EGFR inhibitor. All test compounds were optimized with Autodock Tools®, then molecular docking simulations and predictions of absorption, distribution and toxicity were carried out. Malvidin was stated to meet the Lipinski's Rule of Five, indicating good bioavailability. Result of molecular docking simulation showed that malvidin had better affinity against EGFR than Gefitinib. Molecular docking visualization result showed that malvidin had interaction with amino acid residue such as Met793, Gln791, Leu718, Thr854, Asp855 and Lys745. Absorption and distribution predictions included percentage scores of Human Intestinal Absorption (HIA), human colon adenocarcinoma (Caco-2), and Plasma Protein Binding. Toxicity test revealed that malvidin was mutagenic compound but not carcinogenic one. The findings indicated that malvidin was potential to be an anti lung cancer candidate through EGFR inhibition.Keywords: Antiproliferative, Anthocyanidin, Epidermal Growth Factor Receptor, Molecular Docking
Inflamasi merupakan keadaan yang cenderung merugikan sebagai respon perlindungan tubuh untuk mengurangi dan menghilangkan pemicu terjadinya cedera dan infeksi.1 Salah satu mediator yang berperan dalam peradangan adalah Enzim siklooksigenase (COX).3 Penelitian in vitro menunjukan bahwa daun asam jawa (Tamarindus indica L.) memiliki aktivitas sebagai antiinflamasi.4,5 Penelitian ini menggunakan metode uji in silico dengan melakukan skrinning virtual terhadap senyawa-senyawa aktif di dalam asam jawa. Skrining virtual dilakukan untuk memprediksi senyawa aktif dalam asam jawa yang memiliki aktivitas sebagai antiinflamasi terhadap selektif inhibitor COX-2. Pengujian yang dilakukan meliputi skrining pharmacopore, molecular docking, pengujian lipinsky’s rules of five dan pengujian Pre-ADMET. Dari hasil identifikasi farmakofor dan penambatan molekul diperoleh satu senyawa aktif daun asam jawa sebagai senyawa pemandu terhadap COX-2 yaitu Linalool yang memiliki nilai pharmacophore fit score sebesar 52.11% dan memiliki nilai ikatan energi bebas (∆G) sebesar -9.21 kkal/mol, lebih rendah dibandingkan dengan ligan alaminya yaitu Celecoxib (-7.98 kkal/mol). Dengan residu asam amino ligan alami yang sama terikat pada Linalool yaituTYR371. Dari hasil prediksi parameter absorbsi dan distribusi menunjukkan bahwa senyawa Linalool memiliki nilai Caco-2 cell sebesar 37.4763 nmsec-1, HIA (%) sebesar 96.0055 dan Protein Plasma Binding (%) 95.0547. Kata kunci: antiinflamasi, asam jawa, inhibitor selektif COX-2, penambatan molekul, skrining farmakofor.
This research has been successfully synthesized three compounds of 1,3,5-triaryl pyrazole derivatives by two steps reaction. Firstly, pyrazoline (4a-c) compound was obtained by one-pot reaction of aromatic ketones, aldehyde and hydrazine in basic condition. Then, pyrazole (5a-c) compound was obtained by oxidative aromatization of compound 4 in the presense of acetic acid. Chemical structure of predicted molecules was confirmed by FTIR, NMR and HRMS spectroscopy data analysis. Antiproliferative activity of compound 5a-c were evaluated by in vitro assay against MCF-7 cells line and molecular docking simulation against ERα (PDB ID: 3ERT) using MOE 2019. Biological evaluation result showed that pyrazole compounds had weak antiproliferative activity against MCF-7 cells with IC50 were > 1000 µM, whereas the docking studies agrees the result.
Fluor (fluorine) merupakan unsur paling reaktif, oksidator paling kuat serta memiliki elektronegatifitas paling tinggi. Dalam air fluor biasanya terbentuk sebagai ion fluorida. Air merupakan salah satu sumber asupan fluorida yang cukup tinggi. Penelitian ini bertujuan untuk menetapkan dan membandingkan kadar ion fluorida pada air sumur dan air PAM yang digunakan masyarakat sebagai sumber air minum. Analisis kualitatif dilakukan dengan pereaksi SPADNS-Asam Zirkonil berwarna merah, hasil positif ditandai dengan adanya penurunan intensitas warna pada larutan menjadi lebih pudar atau lebih Jingga. Analisis kuantitatif menggunakan metode kolorimetri dengan penambahan pereaksi SPADNS-Asam Zirkonil dan selanjutnya diukur pada panjang gelombang 582 nm. Data yang diperoleh dilakukan uji statistik menggunakan SPSS 16 dengan One way anova. Hasil penelitian kadar ion fluorida di sekitar pantai berbeda secara signifikan dari sampel air sumur dekat pantai sampai jauh dari pantai. Sedangkan kadar ion fluorida pada sampel air PAM berbeda secara signifikan dari sampel yang bersumber dari sumur dalam, mata air perpompaan, mata air gravitasi, dan sungai. Hasil tersebut menunjukan bahwa jarak dan sumber air mempengaruhi kadar ion fluorida pada air. Kata Kunci :Ion fluorida, air sumur, air PAM, fluorosis tulang dan fluorosis gigi.
Hepatitis B adalah peradangan hati yang disebabkan oleh Virus Hepatitis B (VHB). VHB merupakan virus DNA yang berperan dalam replikasi virus melalui proses transkripsi balik. Tujuan penelitian untuk mendapatkan senyawa yang berpotensi sebagai obat antihepatitis B melalui aktivitas senyawa yang terkandung di dalam rimpang temulawak terhadap reseptor HBV dengan ID protein 1A7L dan 1IUD dengan menggunakan program Autodock Tools. Hasil analisis penambatan molekul terhadap reseptor 1A7L menunjukkan bahwa senyawa curcumin memiliki ?G sebesar -8,05 kkal/mol dan nilai Konstanta Inhibisi (KI) sebesar 1,26 µM, ligan alami memiliki ?G sebesar -8,17 kkal/mol dan nilai KI sebesar 1,03 µM, serta Lamivudin sebagai ligan pembanding memiliki ?G sebesar -7,02 kkal/mol dan nilai KI sebesar 7,13 µM, hasil analisis penambatan molekul reseptor 1IUD menunjukkan senyawa curcumin memiliki ?G sebesar -8,44 kkal/mol dan nilai KI sebesar 647,75 nM, ligan alami memiliki ?G sebesar -6,90 kkal/mol dan nilai KI sebesar 8,78 µM, serta Lamivudin sebagai ligan pembanding memiliki ?G sebesar -5,01 kkal/mol dan nilai KI sebesar 211,47 nM. Hasil prediksi absorbsi dan distribusi menunjukkan senyawa curcumin memiliki nilai Caco2 sebesar 20,07 nm sec-1, persentase HIA sebesar 94,40% dan Protein Plasma Binding sebesar 88,03%. Senyawa curcumin memenuhi semua aturan Lipinski’ serta bersifat non mutagenik dan negatif karsinogenik.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.