La endoscopia es un procedimiento médico invasivo que desempeña un papel importante en el diagnóstico y manejo de la enfermedad inflamatoria intestinal, por lo que nos permite diferenciar la enfermedad de Crohn de la colitis ulcerosa y de otras etiologías que lo asemejan. También permite conocer la extensión y actividad de la enfermedad, monitorear la respuesta a la terapia, además de hacer detección temprana de displasia y cáncer colorrectal, así como ofrecer tratamiento endoscópico en algunos casos, como la estenosis inflamatoria. La cápsula endoscópica, así como los avances en técnicas de imagen nos han brindado herramientas en el diagnóstico de la enfermedad inflamatoria intestinal.