Colorectal cancers (CRC) are among the four most frequently seen cancers in humans and are the second leading cause of cancer-related deaths. Hypoxia up regulates multiple genes involved in different steps of metastatic process, including angiogenesis, proliferation, migration, invasion, motility, adhesion and survival. Hypoxia Inducible Factor 1 (HIF-1) is a master regulator protein of cellular hypoxia-response and triggers the expression of above-mentioned metastatic-process genes. Von Hippel Lindau (VHL) is a protein that plays critical role in the response to hypoxia and product of a tumor suppressor gene. We studied three single nucleotide polymorphisms, rs11549465 (1772C > T), rs11549467 (1790G > A) in HIF-1α and rs779805 (5'UTR A > G) in VHL, and assessed their associations with CRC risk, clinicopathologic and demographic features and lifestyle, and tumor stage and grade of CRC patients and/or healthy controls. ARMS-PCR technique for genotyping of rs11549465 C > T and rs11549467 G>A and PCR-RFLP technique for genotyping of rs779805 A>G were used. CT/TT genotypes of HIF-1α 1772C > T polymorphism were found to increase the risk of colorectal cancer in patients (OR= 1.96, 95% CI= 1.02-3.77, p< 0.05). Additionally, it was demonstrated via statistical analyses that higher age, male gender, cancer history in family, co-existing diseases, and exposure to white soil stands to be risk factors of colorectal cancer (p< 0.05). No significant relation was found between patient's TNM stages and distributions of genotype (p> 0.05). The findings from our study demonstrates that, in addition to risk factors for colorectal cancer, scanning CT/TT genotypes of HIF-1α C1772T polymorphism can be advantageous in early-diagnosis of colorectal cancer.Keywords: Colorectal cancer, HIF-1α, VHL, rs11549465, rs11549467
ÖZET
Kolorektal Kanser Riski ile Hipoksiyle İndüklenen Faktör-1 Alfa (HIF-1α) ve von Hippel-Lindau (VHL)Kolorektal kanser insanda sık görülen dört kanser türü arasında yer alır ve ölüme götüren kanserler içerisinde ikinci sıradadır. Hipoksi, anjiogenez, proliferasyon, migrasyon, invazyon, adhezyon ve sağkalımı içeren metastatik süreçte rol alan pek çok geni kontrol eder.Birçok kanser türünün gelişmesinde etkili olduğu düşünülen HIF-1α gen proteini hücrenin hipoksiye cevabının anahtar regülatörüdür.VHL proteini tümör baskılayıcı bir genin ürünü olup, hipoksiye cevap yolağında önemli rol alır. Biz bu çalışmada, HIF-1α geninin rs11549465 (1772C > T), rs11549467 (1790G > A) polimorfizmleri ile VHL geninin rs779805 (5'UTR A > G) polimorfizmini ve ayrıca yaş, cinsiyet, ailede kanser öyküsü, sistemik hastalıklar, beyaz toprak maruziyeti, sigara ve alkol tüketimi ile CRC riski arasındaki ilişkiyi araştırdık. Çalışmaya, histolojik olarak teyit edilen CRC tanısı almış 92 hasta ile kontrol grubu olarak 101 birey katıldı. DNA izolasyonu için periferal kan kullanıldı. HIF-1α genindeki rs11549465 C > T ve rs11549467 G>A polimorfizm değişimlerini genotiplemek için ARMS-PZR; VHL rs779805 A > G polimorfizm değişimini genotipleme...