Molecular phylogeny and divergence times of ancient South American and Malagasy river turtles (Testudines: Pleurodira: Podocnemididae)

Vargas‐Ramírez, Mario; Castaño-Mora, Olga Victoria; Fritz, Uwe

doi:10.1016/j.ode.2008.10.001

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“…Our resolution of these species is: (P. vogli (P. lewyana (P. unifilis (P. erythrocephala (P. sextuberculata, P. expansa))))). There is virtually nothing in common with this resolution and the molecular study of Vargas- Ramírez et al (2008). Most of the characters we have used that actually resolve these species are frequently subject to homoplasy in other turtle taxa, and are reversed within our own study, so we do not consider this part of the analysis to be strongly supported as the resolution collapses into a multichotomy at one step more than the shortest resolution ( fig.…”

Section: Peiropemys New Genusmentioning

confidence: 99%

Evolution of the Side-Necked Turtles: The Family Podocnemididae

Gaffney

Meylan

Wood

et al. 2011

Bulletin of the American Museum of Natural History

128

351

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Section: Peiropemys New Genusmentioning

confidence: 99%

Evolution of the Side-Necked Turtles: The Family Podocnemididae

Gaffney

Meylan

Wood

et al. 2011

Bulletin of the American Museum of Natural History

128

351

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“…P. expansa is listed in the threat category ''Lower Risk/Conservation Dependent'' by the IUCN Red List of Threatened Species (IUCN 2010); P. erythrocephala, P. sextuberculata and P. unifilis are treated as ''Vulnerable'', and P. lewyana is classified as ''Endangered''. Among the many chelonians under extreme pressure from human exploitation (Klemens 2000), Podocnemis species deserve particular attention as conservation targets because they represent ancient lineages (Vargas-Ramírez et al 2008;Gaffney et al 2011).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…As one of the three chelonian species endemic to Colombia (besides P. lewyana: Kinosternon dunni, Mesoclemmys dahli; Fritz and Havaš 2007), the country has a special responsibility to conserve P. lewyana. Phylogenetically, P. lewyana is sister to the Amazonian blackwater species P. erythrocephala (Vargas-Ramírez et al 2008).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Extremely low genetic diversity and weak population differentiation in the endangered Colombian river turtle Podocnemis lewyana (Testudines: Podocnemididae)

Vargas‐Ramírez¹,

Stuckas²,

Castaño-Mora

et al. 2011

Conserv Genet

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Podocnemis lewyana is an endangered endemic river turtle of Colombia. Using ten unlinked polymorphic microsatellite loci and a 691-bp-long DNA fragment corresponding to the more variable portion of the mitochondrial control region, we investigated genetic diversity and population structure throughout its range. Both neutral markers showed extremely low diversity and weak population differentiation. Our data indicate that the genetic history of P. lewyana has been impacted by multiple bottlenecks and population expansion since the Pleistocene. The observed differentiation pattern is most likely the result of historically low genetic variation resulting from restricted geographic range and aggravated by recent anthropogenically induced bottlenecks. Based on slight differences in allele frequencies among populations, we suggest that three regions should be treated as demographically independent Management Units in order to preserve maximal genetic diversity: (1) the Upper Magdalena River Basin, (2) the Lower Magdalena ? Lower Cauca ? San Jorge River Basins, and (3) the Sinú River Basin. Among the Management Units, only low to moderate levels of gene flow were detected; these are largely unidirectional from Management Units 1 and 3 into Management Unit 2.Resumen Podocnemis lewyana es una tortuga endémica y amenazada de Colombia. Usando diez loci polimórficos de microsatélites y un fragmento de 691 pares de bases correspondiente a la porción más variable de la región control mitocondrial, investigamos la diversidad genética y estructura poblacional a través de su rango de distribución. Ambos marcadores neutrales revelaron una diversidad extremadamente baja y débil diferenciación poblacional. Nuestros datos indican que la historia genética de P. lewyana ha sido impactada por múltiples cuellos de botella y expansión poblacional desde el Pleistoceno. El patrón de diferenciación observado es más probable el resultado de la variación genética historica baja derivada del rango de distribución restringido, agravada por cuellos de botella recientes resultado de intervención antrópica. Basados en diferencias tenues de frecuencias alélicas entre poblaciones, sugerimos que tres regiones deben ser tratadas como Unidades de Manejo (UM) demográficamente independientes con el fin de preservar al máximo la diversidad genética. (1) Cuenca del alto río Magdalena, (2) Cuencas del bajo río Magdalena ? Bajo río Cauca ? río San Jorge, y (3) Cuenca del río Sinú. Entre las UM se detectaron niveles bajos a moderados de flujo genético que es principalmente unidireccional de las UM 1 y 3 a la UM 2.

show abstract

“…En particular, la presencia de P. lewyana en el norte de Colombia, a diferencia de los demás representantes de la familia Podocnemididae, que se encuentran en las cuencas del Amazonas y Orinoco, estuvo determinada por el surgimiento de la Cordillera Oriental (Vargas-Ramírez et al, 2008). El levantamiento del Istmo de Panamá, que facilitó el arribo de tortugas Cryptodiras de Norte y Centroamérica, las cuales se adaptaron muy bien a las condiciones tropicales, jugó igualmente un importante papel en la restricción y distribución actual de los podocnemídidos (Cadena, 2012).…”

Section: Discussionunclassified

Potential Distribution of Podocnemis lewyana (Reptilia:Podocnemididae) and Its Possible Fluctuation Under Different Global Climate Change Scenarios

Ortiz-Yusty¹,

Restrepo²,

Páez³

2014

Acta biol. colomb.

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RESUMENEn este estudio se implementó el modelaje de distribución de especies para establecer el rango de distribución potencial de Podocnemis lewyana, explorar los componentes del clima que pueden influenciar dicha distribución y evaluar posibles fluctuaciones de su distribución bajo escenarios de clima futuro. Los modelos obtenidos predicen una distribución continua de sur a norte por todo el río Magdalena, desde los municipios de Rivera y Palermo en el departamento de Huila, hasta los departamentos de Atlántico y Magdalena en el norte. La temperatura fue el elemento del clima que más influyó en la distribución de P. lewyana; esta especie tiende a estar presente en climas cálidos y con poca variabilidad en la temperatura. El modelo de distribución transferido a los escenarios de clima futuro predicen un aumento en el rango geográfico de P. lewyana. Sin embargo, teniendo en cuenta las preferencias de hábitat de esta especie y su fuerte asociación con los cuerpos de agua, este resultado debe tomarse con cautela, dado que el modelo solo tuvo en cuenta variables climáticas terrestres. Dadas las características de historia de vida de esta especie (presencia de determinación sexual dependiente de la temperatura, alta temperatura pivotal y un rango de transición de temperatura muy estrecho), y el efecto negativo de los cambios en los regímenes hidrológicos en la mortalidad embrionaria, la expansión del área potencial de P. lewyana en el futuro no significa que esta especie no vaya a verse afectada por el cambio climático global.Palabras clave: Maxent, modelación de nicho, variables ambientales. ABSTRACTWe implemented a species distribution modelling approach to establish the potential distribution of Podocnemis lewyana, to explore the climatic factors that may influence the species' distribution and to evaluate possible changes in distribution under future climate scenarios. The distribution models predicted a continuous distribution from south to north along the Magdalena River, from Rivera and Palermo in the department of Huila to the departments of Atlántico and Magdalena in the north. Temperature was the variable most influential in the distribution of P. lewyana; this species tends to be present in warm regions with low temperature variability. The distribution model predicted an increase in the geographic range of P. lewyana under climate change scenarios. However, taking into account the habitat preferences of this species and its strong

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Molecular phylogeny and divergence times of ancient South American and Malagasy river turtles (Testudines: Pleurodira: Podocnemididae)

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Evolution of the Side-Necked Turtles: The Family Podocnemididae

Evolution of the Side-Necked Turtles: The Family Podocnemididae

Extremely low genetic diversity and weak population differentiation in the endangered Colombian river turtle Podocnemis lewyana (Testudines: Podocnemididae)

Potential Distribution of Podocnemis lewyana (Reptilia:Podocnemididae) and Its Possible Fluctuation Under Different Global Climate Change Scenarios

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