Molecular genetic diagnostics of clear cell renal cell carcinoma

Apanovich, Natalya; Peters, M. V.; Korotaeva, Alexandra; Апанович, П. В.; Маркова, А. С.; Камолов, Б. Ш.; Матвеев, В. Б.; Карпухин, А. В.

doi:10.17650/1726-9776-2016-12-4-16-20

Cited by 8 publications

(11 citation statements)

References 13 publications

(14 reference statements)

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…It is a direct target of the HIF1α gene [40]. The importance of NDUFA4L2 expression for the development of ccRCC was first shown by us [41] and then in other papers [42][43][44]. In addition to ccRCC, this gene is overexpressed in non-small cell lung cancer (NSCLC), as well as in NSCLC cell lines cultured under hypoxia.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

The Genes—Candidates for Prognostic Markers of Metastasis by Expression Level in Clear Cell Renal Cell Cancer

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

The molecular prognostic markers of metastasis are important for personalized approaches to clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) treatment but markers for practical use are still missing. To address this gap we studied the expression of ten genes—CA9, NDUFA4L2, VWF, IGFBP3, BHLHE41, EGLN3, SAA1, CSF1R, C1QA, and FN1—through RT-PCR, in 56 ccRCC patients without metastases and with metastases. All of these, excluding CSF1R, showed differential and increased (besides SAA1) expression in non-metastasis tumors. The gene expression levels in metastasis tumors were decreased, besides CSF1R, FN1 (not changed), and SAA1 (increased). There were significant associations of the differentially expressed genes with ccRCC metastasis by ROC analysis and the Fisher exact test. The association of the NDUFA4L2, VWF, EGLN3, SAA1, and C1QA expression with ccRCC metastasis is shown for the first time. The CA9, NDUFA4L2, BHLHE4, and EGLN3 were distinguished as the strongest candidates for ccRCC metastasis biomarkers. We used an approach that presupposed that the metastasis marker was the expression levels of any three genes from the selected panel and received sensitivity (88%) and specificity (73%) levels with a relative risk of RR > 3. In conclusion, a panel of selected genes—the candidates in biomarkers of ccRCC metastasis—was created for the first time. The results might shed some light on the ccRCC metastasis processes.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

The Genes—Candidates for Prognostic Markers of Metastasis by Expression Level in Clear Cell Renal Cell Cancer

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Depending on the requirements for sensitivity, reliability of determination, or ease of implementation, various combinations of these genes are possible. повысить, вернувшись к бόльшему числу применяемых маркеров и добавив определение экспрессии генов EGLN3 и NDUF4L2, также связанных с скПКР [10]. Эти гены также оказались значимо высокоассоциированными с скПКР (р = 0,00 005 и 0,0005 соответственно).…”

Section: Discussionunclassified

“…Эти гены также оказались значимо высокоассоциированными с скПКР (р = 0,00 005 и 0,0005 соответственно). Следует отметить, что ассоциация каждого из изученных в данной работе генов с скПКР суммарно с выполненными ранее работами [9,10] Как обнаружено при анализе, 1 образец опухоли не показал связи ни с одним маркером. Вероятность случайности такого события можно ориентировочно оценить как (1 / 2) 8 = 0,004, т. е. данный образец, скорее всего, был ошибочно отнесен к опухоли скПКР.…”

Section: Discussionunclassified

“…Изученные в настоящей работе гены были выбраны на основании предыдущего исследования более широкого их набора, как продемонстрировавшие наилучшие результаты в качестве диагностических маркеров [9,10].…”

Section: Discussionunclassified

See 1 more Smart Citation

A joint determination of gene expression and methylation for the diagnosis of clear cell renal cancer

et al. 2019

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Светлоклеточный почечно-клеточный рак -самый частый и наиболее агрессивный рак почки. Примерно у 30 % пациентов при первичной постановке диагноза выявляют отдаленные метастазы. Это связано с тем, что рак почки на ранних стадиях протекает бессимптомно. Часто (~50 % случаев) рак почки выявляют случайно, при профилактическом осмотре или при обращении по другим причинам. В связи с этим актуально развитие новых методов ранней диагностики светлоклеточного почечно-клеточного рака. Материалы и методы. Изучены уровни экспрессии матричной РНК и метилирования ряда генов в операционном материале парных образцов (нормальная ткань / опухоль почки; n = 21). Количественное определение экспрессии генов проводили с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени на приборе Step One Plus (Applied Biosystems, США) с использованием наборов TaqMan ® Gene Expression Assays (Applied Biosystems, США). Высокомолекулярную ДНК выделяли из ткани методом фенол-хлороформной экстракции. Метилспецифичную полимеразную цепную реакцию проводили на амплификаторe T100 Thermal Cycler (Bio-Rad, США).

show abstract

“…Проблема поиска маркеров метастазирования достаточно значима, так как фактически они являются прогнозом метастатических рецидивов. В литературе имеются сообщения о маркерах диагностики и прогноза метастазирования ПКР на основе анализа экспрессии генов, в том числе выполненные авторами настоящей работы [26][27][28][29], а также на основе экспрессии миРНК, например miR-429, или миРНК семейства miR-200 [30,31]. Набор из 3 миРНК (miR-21, -142-3p, -194) позволил прогнозировать метастазирование ПКР с чувствительностью 86,7 % и специфичнос тью 82,0 % [32].…”

Section: рис 2 ассоциация метилирования генов микрорнк с клинико-гиunclassified

Methylation of a group of microRNA genes: markers of renal cell carcinoma metastasis

et al. 2021

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Почечно-клеточный рак (ПКР) не имеет симптомов вплоть до поздних стадий и характеризуется высокой частотой летальных исходов, достигающей 90 % при развитии метастатического процесса. Цель исследования-определение группы генов микроРНК, метилирование которых ассоциировано с прогрессированием заболевания, в частности с метастазированием.

show abstract

Molecular genetic diagnostics of clear cell renal cell carcinoma

Cited by 8 publications

References 13 publications

The Genes—Candidates for Prognostic Markers of Metastasis by Expression Level in Clear Cell Renal Cell Cancer

The Genes—Candidates for Prognostic Markers of Metastasis by Expression Level in Clear Cell Renal Cell Cancer

A joint determination of gene expression and methylation for the diagnosis of clear cell renal cancer

Methylation of a group of microRNA genes: markers of renal cell carcinoma metastasis

Contact Info

Product

Resources

About