La bataille du silence

Abstract

505 SYNTHÈSE REVUESDécouvert au début des années 1990 [1,2], le méca-nisme du « RNA silencing » a complètement révolu-tionné notre façon d'appréhender la régulation de l'expression du génome chez les eucaryotes. Le terme « RNA silencing » (que nous préférons garder dans son appellation anglophone) englobe, de manière générale, l'ensemble des mécanismes conduisant à la suppression de l'expression de gènes, au niveau transcriptionnel ou post-transcriptionnel, via des interactions séquence-spécifiques médiées par l'ARN. Présent de l'algue unicellulaire Chlamydomonas reinhartii à l'homme, et hautement conservé chez la quasi-totalité des organismes eucaryotes, le RNA silencing joue un rôle essentiel dans un grand nombre de processus biologiques, par exemple le maintien de la stabilité des génomes (en réprimant le mouvement des éléments mobiles du génome que sont les transposons) ou le contrôle de l'expression de gènes au cours du développement, nécessaire à leur bon déroule-ment et inversement participe à de nombreuses pathologies comme le cancer (➜) [3, 4, 61].Dans tous les cas, l'ARN double brin (ARNdb) est la molécule clé initiatrice du silencing [5]. L'ARNdb peut être produit in vivo soit par transcription de séquences génomiques organisées en répétitions inversées, à partir de promoteurs convergents ou via l'action d'ARN polymérases ARN-dépendantes (RdRp) d'origine endogène ou virale qui convertiront un ARN simple brin (ARNsb) en ARNdb. Cet ARNdb est reconnu par une enzyme de type RNase III appelée Dicer [6] qui va produire la seconde catégorie de molécules ubiquitaires du RNA silencing que sont les petits ARN (small ARN ou sARN) [7,8] (Figure 1). Ces sARN, de 21-24nt de longueur, vont ensuite être incorporés dans un complexe multiprotéique appelé RISC (RNA-induced silencing complex) où ils serviront de guide pour lui permettre de retrouver, de manière séquence-spécifique, tout espèce d'acides nucléiques présentant une séquence complémentaire [9]. Selon la nature du complexe RISC impliqué, cette reconnaissance entraînera une répression de l'expression du gène, soit post-transcriptionnelle, par clivage endonucléolytique ou inhibition de la traduction de l'ARN > Le RNA silencing est un mécanisme opéré par de petites molécules d'ARN qui inhibent l'expression de gènes tant au niveau transcriptionnel que post-transcriptionnel via des interactions séquence-spécifiques. Conservé chez la plupart des eucaryotes, ce phénomène est impliqué dans le maintien de l'intégrité des génomes ou dans la régulation de facteurs spécifiques au cours du développement, aussi bien chez les animaux que chez les plantes. Chez ces dernières, le RNA silencing joue également un rôle crucial dans la défense antivirale. Pour contrer cette réponse, les virus ont développé une batterie de stratégies pour inhiber ce mécanisme. Cette revue détaille les mécanismes du RNA silencing et de son inhibition au cours des interactions plante/ virus et suggère les possibles conséquences de cette bataille moléculaire sur l'évolution de leur génomes respectifs. <

Gas temperature dependent sticking of hydrogen on cold amorphous water ice surfaces of interstellar interest

“…Indeed, for a surface being irradiated with a direct effusive beam, a privileged direction exists and the real velocity distribution of the effusive beam must be taken into account. The velocity distribution of an effusive beam 26…”

Germ Cell-Specific Targeting of DICER or DGCR8 Reveals a Novel Role for Endo-siRNAs in the Progression of Mammalian Spermatogenesis and Male Fertility

“…Canonical miRNAs are initially transcribed as pri-miRNAs, which are recognized in the nucleus by the dsRNA-binding protein DGCR8 and processed by the RNase III endonuclease DROSHA into 70-nucleotide pre-miRNAs [10], [11]. These are then exported into the cytoplasm and further cleaved by DICER1, another RNase III endonuclease, to produce 21–25 nucleotide small dsRNAs [12]. These mature miRNAs are subsequently incorporated into RNA-induced silencing complexes (RISC).…”

Les petits ARN nucléolaires nous surprennent encore !

“…En 2008, une étude a montré l'existence de petits ARNnc stables, produits de maturation de snoARN précurseurs [3]. La même année, deux autres groupes ont identifié des petits ARNnc dérivés de snoARN en association avec des protéines Argonautes (Ago1 et Ago2), protéines qui s'associent aux microARN au sein des particules RISC (RNA induced silencing complex) impliquées dans le silencing des gènes [4,5,45]. Ainsi, une nouvelle classe de petits ARN dérivés de snoARN a été mise en évidence : les sdARN (snoRNA-derived small RNA, petits ARN dérivés de snoARN).…”

“…En effet, la position à modifier dans l'ARN cible est spécifiée par la complémenta-rité des bases entre de courtes séquences antisens localisées dans les snoARN et les séquences de leurs ARN cibles (Figure 1). [4] ont montré que cette maturation était, dans ce cas, indépendante de la RNase de type III Drosha, mais nécessitait l'action de la RNase de type III Dicer, toutes deux impliquées dans la maturation classique des microARN [45]. Enfin, les auteurs ont montré, par un test rapporteur, que le sdARN ACA45 pouvait cibler l'ARNm codant pour une sousunité protéique du médiateur CDC2L6.…”