Integrated genetic map of citrus based on RAPD markers

Abstract

Integrated genetic map of citrus based on RAPD markers.Abstract --Introduction. The citrus industry is one of the main activities of Brazilian agriculture. Several pests and diseases have threatened citrus culture in recent years. Genetic mapping is one of the most efficient strategies for conducting advanced genetic studies by facilitating plant selection guided by markers. The objective of this study was to construct an integrated genetic map between Citrus sinensis (L.) Osbeck cv. 'Pêra' and C. reticulata Blanco cv. 'Cravo' using two different types of segregation of markers. Materials and methods. The linkage analyses were conducted with segregation data obtained from 256 RAPD markers in a population of 94 hybrids. Analyses were performed through the software JoinMap, LOD ≥ 6.0, θ ≤ 0.25, and the Kosambi function. Results and discussion. The linked map between the two cultivars had 217 markers defined by 15 linkage groups, covering 527 cM. This map had five linkage groups with common markers of 'Pêra' and 'Cravo'. The inclusion of new markers would increase the number of linkage groups with markers from both parents, thus making their number equal to the haploid chromosome number. The alterations in the order and in the distances among the markers, due to the presence or absence of bridging markers in the linkage map, are discussed. Citrus reticulata / Citrus sinensis / genetic maps / genetic markers / RAPDCarte génétique intégrée des agrumes, basée sur l'utilisation de marqueurs RAPD.Résumé --Introduction. L'industrie des agrumes est l'une des activités principales de l'agriculture brésilienne. Plusieurs ravageurs et maladies ont menacé cette culture ces dernières années. La cartographie moléculaire est l'une des stratégies les plus efficaces pour entreprendre des études génétiques avancées afin de faciliter une sélection des plants assistée par marqueurs. L'objectif de cette étude a été de construire une carte génétique intégrée entre Citrus sinensis (L.) Osbeck cv. 'Pêra' et C. reticulata Blanco cv. 'Cravo' en utilisant deux types différents de ségrégation des marqueurs. Matériel et méthodes. Les analyses de liaisons ont été conduites à partir de données de ségrégation obtenues de 256 marqueurs RAPD dans une population de 94 hybrides. Les analyses ont été réalisées avec le logiciel JoinMap. Résultats et discussion. La carte des liaisons entre l'un et l'autre des cultivars a comporté 217 marqueurs définis par 15 groupes de liaisons, couvrant 527 cM. Cette carte a présenté cinq groupes de liaisons contenant les marqueurs communs de Pêra et Cravo. L'inclusion de nouveaux marqueurs augmenterait le nombre de groupes de liaisons portant des marqueurs des deux parents, en rendant leur nombre égal au nombre de chromosomes haploïde. Les différences d'ordre et de distances au sein des marqueurs, dues à la présence ou à l'absence de marqueurs dans la carte de liaisons, sont discutées. Citrus reticulata