Global Biodiversity Informatics: setting the scene for a “new world” of ecological forecasting

Abstract

Abstract.--Recent developments in information and communication technology are allowing new experiences in the integration, analysis and visualization of biodiversity information, and are leading to development of a new field of research, biodiversity informatics. Although this field has great potential in diverse realms, including basic biology, human economics, and public health, much of this potential remains to be explored. The success of several concerted international efforts depends largely on broad deployment of biodiversity informatics information and products. Several global and regional efforts are organizing and providing data for conservation and sustainable development research, including the Global Biodiversity Information Facility, the European Biodiversity Information Network, and the Inter-American Biodiversity Information Network. Critical to development of this field is building a biodiversity information infrastructure, making primary biodiversity data freely and openly available over the Internet. In addition to specimen and taxonomic data, access to non-biological environmental data is critical to spatial analysis and modeling of biodiversity. Adoption of standards and protocols and development of tools for collection management, datacleaning, georeferencing, and modeling tools, are allowing a quantum leap in the area. Open access to research data and open-source tools are leading to a new era of web services and computational frameworks for spatial biodiversity analysis, bringing new opportunities and dimensions to novel approaches in ecological analysis, predictive modeling, and synthesis and visualization of biodiversity information.

¿La crisis de la biodiversidad es la crisis de la taxonomía?

“…Ello ha obligado a buscar mecanismos para integrar dicha información de la mejor manera posible, sintetizarla y hacerla accesible para todos los interesados. La búsqueda eficiente de tales mecanismos ha generado lo que se conoce en la actualidad como la informática de la biodiversidad (Canhos et al, 2004;Soberón y Peterson, 2004). La captura de la información biológica almacenada en las colecciones es la primera etapa para hacerla accesible y útil.…”

Biodiversity informatics: global trends, national perspective and regional progress in Khanty-Mansi Autonomous Okrug

“…Важным основанием для организации международных программ по интеграции данных о биологическом разнообразии является Конвенция о Биологическом разнообразии (Convention on Biological Diversity, CBD) (https://www.cbd.int), ратифицированная Россией в 1995 г. В статье 17 Конвенции постулируется необходимость объединения усилий всех стран для оценки собственных биологических ресурсов. Очевидно, что изучение биологического разнообразия на мировом уровне или уровне крупных регионов возможно только благодаря согласованным действиям многих стран [Canhos et al, 2004]. В 2010 г. Стороны Конвенции приняли Стратегический план в области сохранения и устойчивого использования биоразнообразия на 2011-2020 гг.…”

“…Ведущей инфраструктурой является GBIF, образовавшийся на основе межправительственных соглашений в 2001 г. на совещании Megascience Forum на конференции Организации экономического сотрудничества и развития (Organisation for Economic Co-operation and Development, OECD). Целью проекта является создание глобального портала данных о биологическом разнообразии и решение следующих задач: 1) стимулирование оцифровки данных естественно-научных коллекций, 2) обеспечение доступности данных и их совместимости, 3) создание электронного каталога названий всех биологических организмов, 4) пропаганда основ и развитие теории ИБ [Canhos et al, 2004;Lane, Edwards, 2007]. На момент подготовки статьи через портал GBIF.org доступны данные о 737 816 656 находках 1 718 908 видов.…”

“…В Европе до этого успешно работает сеть Таксономических организаций (The Consortium of European Taxonomic Facilities, http://www.cetaf.org), способствующая объединению баз данных таксономических систем растений, наземных и морских животных. Кроме того, создавались сети для решения задач связанных с разработкой стандартов баз данных, например The European Natural History Specimen Information Network [Canhos et al, 2004].…”

The Real Task of Selecting Records for Ecological Niche Modelling

“…Access to this information is being improved as more records are digitized and shared with biodiversity data networks. In Brazil, the speciesLink network (Canhos et al 2004) has recently reached 4 million records from biological collections and is steadily growing at half million records per year. Considering only plant specimens from Brazilian collections, speciesLink currently provides access to ~2.3 million records, corresponding to approximately 38% of all holdings stored in Brazilian herbaria (assumed be around 6 million according to Egler & Santos 2006).…”