Genetic diversity and population structure of pumas (Puma concolor) in southeastern Brazil: implications for conservation in a human-dominated landscape

Abstract

São Paulo is the most populous, developed and industrialized state of Brazil. Despite of intensive human activities, large habitat loss and fragmentation of the native vegetation cover, pumas (Puma concolor) still inhabit remnant habitat fragments in the northeastern area of the state. We investigated the occurrence of genetic structure and levels of genetic variability on pumas to aggregate basic information for conservation efforts to maintain long term viable populations of this top-predator in the region. By analyzing microsatellite loci variation, we corroborated the hypothesis of absence of genetic structure, and estimated high levels of genetic diversity (expected heterozygosity of 0.79 and mean of 10 alleles per locus). In spite of the increasing number of roadkilling and puma-human conflicts in the area, apparently pumas still maintain some level of gene flow between protected areas of the region. The observed excess of heterozygotes suggests a recent bottleneck event in this population, probably a consequence of the profound landscape transformation of the studied area during the last century; another possibility is this may be due to the observed deviation in the population sex ratio, which may be influencing the pumas' mating system. We propose that: (1) landscape management in the study area should be focused on increasing habitat connectivity, creating protected areas and structures to allow highway crossing of pumas;(2) educational actions should be undertaken to change community perception of large carnivores, and possibly the implementation of compensatory actions to ranchers.

Evidence of Recent Fine-Scale Population Structuring in South American Puma concolor

“…In order to confirm if the samples belonged to Puma concolor, we amplified a fragment of 146 bp from cytochrome b of mitochondrial DNA using the primers described by Farrel et al [24], as previously used by Miotto et al [17,25,26] for cougar identification. We adopted the PCR protocol described by Miotto et al [25] using a Veriti 96-Well Thermal Cycler (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA).…”

Educação Ambiental E a Conservação Da Onça Parda: Potenciais Das Unidades De Conservação Do Nordeste Paulista

“…As sete unidades se encontram próximo às áreas urbanas, rodovias e propriedades rurais. Essa condição está diretamente relacionada às ameaças sofridas pela população de onças pardas: perda de habitats, atropelamentos e conflitos resultantes da interação com criação de animais domésticos em propriedades rurais (Miotto et al, 2011;2012). Por outro lado, permite fácil acesso da população a esses espaços, o que potencializa as ações de uso público.…”

“…Definimos a área de estudo desse trabalho com base na pesquisa sobre a população de onças pardas conduzida por Miotto et al (2011;2012). Optamos por esta área de estudo por ela nos permitir integrar a pesquisa em conservação da biodiversidade com a pesquisa em educação ambiental, buscando compreender aspectos humanos necessários para a conservação da biodiversidade no Estado de São Paulo.…”

“…Esse potencial é ainda maior nas unidades de uso sustentável, onde a vocação do espaço já é voltada para esse fim. Esse resultado é de extrema importância, pois as onças não estão restritas aos limites da unidade de conservação (Miotto et al, 2011;2012) e o interesse de recuperação das áreas naturais do entorno é fundamental para melhorar a qualidade ambiental da paisagem. Desse modo, destacamos esse tema como um dos que possui maior relevância para a educação ambiental para a conservação da onça parda no nordeste paulista, já que é atrativo para o público adulto e essencial para a melhoria de habitats para a espécie.…”

“…Além disso, a maioria das unidades de conservação possui dimensões pequenas e se encontra com pouca conectividade na paisagem (Rodrigues e Bononi, 2008). Nas últimas décadas, o intenso crescimento dos centros urbanos e da malha rodoviária da região nordeste do Estado tem gerado pressões sobre a população de onças pardas residente, especialmente pela perda de habitats, atropelamentos e conflitos com seres humanos e suas criações domésticas (Miotto et al, 2011;2012).…”