Genetic characterization of Brazilian bovine viral diarrhea virus isolates by partial nucleotide sequencing of the 5'-UTR region

Abstract

As amostras foram agrupadas em BVDV-1 (11/19), BVDV-2 (6/19) e num terceiro grupo de amostras denominadas "atípicas" (2/ 19). Das onze amostras genotipadas como BVDV-1, oito amostras foram sub-genotipadas como BVDV-1a, enquanto que a maioria (4/6) das amostras de BVDV-2 foi agrupada como BVDV2b. Duas amostras provenientes de fetos bovinos abortados foram classificadas como atípicas, não BVDV-1 e 2. A presença da diversidade genética de BVDV detectada nas amostras estudadas pode ser responsável por falhas vacinais e de diagnóstico e deve influenciar nas estratégias de controle do BVDV aplicadas nas diferentes regiões brasileiras.TERMOS DE INDEXAÇÃO: BVDV-1, BVDV-2, Pestivirus, Brazil, análise filogenética. INTRODUCTION INTRODUCTION INTRODUCTION INTRODUCTION INTRODUCTIONInfections of cattle by bovine viral diarrhea virus (BVDV) are widespread cause of major economic losses to the cattle industry (Houe 1999). Clinical symptoms may involve the reproductive, respiratory, immune, and gastrointestinal systems, with signs that may range from disease with high mortality rates to asymptomatic infections. The latter is observed in most cases (Pellerin et al. 1994, Ridpath et al.1994, Baker 1995, Fray et al. 2000.BVDV is an enveloped RNA virus that belongs to family Flaviviridae, genus Pestivirus. The viral positive single stranded genome of approximately 12.5 kb in size contains a single open reading frame (ORF) flanked by two non-translating terminal regions, named 5' and 3'-UTR. The single ORF is directly translated and gives rise to a long polyprotein which is co-translationally cleaved, originating 10 to 12 mature viral proteins (Collet et al. 1988, Meyer et al. 1989.Isolates have been subdivided in genotypes BVDV-1 and BVDV-2. These were further split into subgenotypes.

Detecção do virus ‘HoBi’-like (BVDV-3) em bovino no semiárido do Estado da Paraíba

“…Alguns autores afirmam que o BVDV-3, em infecções naturais e experimentais, também está relacionado a síndromes respiratórias (Decaro et al 2011, 2012b, Larska et al 2012, abortos (Cortez et al 2006, Bianchi et al 2011, Decaro et al 2012a) e episódios de pirexia sem outras manifestações clínicas , de maneira que estas afecções são clinicamente semelhantes àquelas causadas pelo BVDV-1 e BVDV-2 (Decaro et al 2013, Weber et al 2014.…”

Species characterization in the genus Pestivirus according to palindromic nucleotide substitutions in the 5′-untranslated region

“…Pestivirus strains showing unexpected genomic sequences such as M a n u s c r i p t 9 Giraffe (Plowright, 1969), Wisent Casimir (Becher et al, 1999), Chamois-1 (Arnal et al, 2004), Pronghorn (Vilček et al, 2005), HoBi group strains (Schirrmeier et al, 2004;Cortez et al, 2006;Liu et al, 2009a) and Bungowannah (Kirkland et al, 2007) have been characterized easily and clustered within the genus by PNS method. The procedures require constant adaptability to eventual new and different observations.…”

Proteção fetal contra o vírus da diarréia viral bovina (BVDV) em vacas prenhes previamente imunizadas com uma vacina experimental atenuada

“…No presente estudo, foram utilizadas amostras dos vírus obtidas na passagem 30 (p30) do trabalho original de obtenção das cepas vacinais. As amostras utilizadas no desafio são isolados brasileiros NCPs, pertencentes ao genótipo BVDV-1 (SV-126.8 e UFSM-1) e genótipo BVDV-2 (SV-63 e SV-260) (Flores et al 2005, Cortez et al 2006.…”

“…Não obstante esses esforços, nenhuma vacina testada até o presente foi capaz de conferir total proteção aos fetos, o que representa um obstácu-lo para o efetivo controle da infecção pelo uso da vacinação (Kelling 2004). A infecção pelo BVDV está amplamente difundida no rebanho bovino brasileiro, e amostras de ambos os genótipos e com diferenças genéticas e antigênicas das cepas americanas já foram identificadas no país , Cortez et al 2006. Essa diversidade gené-tica e antigênica possui implicações práticas para o diagnóstico, produção de vacinas e estratégias de controle da enfermidade (Flores et al 2005).…”