Phallotorynus victoriae distribui-se nas drenagens dos rios Paraná e Uruguai, no Brasil, Argentina, Paraguai e Uruguai. No Brasil, ocorre nos estados de São Paulo, Mato Grosso do Sul e Rio Grande do Sul. Apesar dos desmatamentos e plantios de cana-de-açúcar representarem impactos em parte de sua distribuição, não há indícios de risco de extinção no futuro próximo. Por este motivo, P. victoriae foi categorizada como Menos Preocupante (LC).