Development of Specific Primers for the Molecular Detection of Bacterial Spot of Pepper and Tomato

Koenraadt, H.; Betteray, B. van; Germain, R N; Hiddink, G.A.; Jones, J. B.; Oosterhof, J.; Rijlaarsdam, A.; Roorda, P.; Woudt, B.

doi:10.17660/actahortic.2009.808.13

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“…Aqueous suspensions of presumptive isolates (containing approximately 10 6 cfu mL -1 ) can be identified using a series of conventional PCR tests (Appendix 3) as described by Koenraadt et al (2009).…”

Section: Polymerase Chain Reaction Methodsmentioning

confidence: 99%

“…Appendix 3 -Conventional PCR tests according to Koenraadt et al (2009) 1. General information 1.1 Two conventional duplex-PCR tests are available for identification purposes to distinguish the four described species: X. euvesicatoria, X. vesicatoria, X. gardneri and X. perforans.…”

mentioning

confidence: 99%

“…Using amplification fragment length polymorphism (AFLP) analysis, a specific marker has been identified previously for each of the four described species. Based on the sequence data of these markers, 4 primer combinations, Bs-XeF/Bs-XeR, BsXvF/Bs-XvR, Bs-XgF/Bs-XgR and Bs-XpF/Bs-XpR, have been developed, amplifying a specific fragment of each of the four species (Koenraadt et al, 2009 Xanthomonas euvesicatoria …”

mentioning

confidence: 99%

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PM 7/110 (1) Xanthomonas spp. (Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas vesicatoria) causing bacterial spot of tomato and sweet pepper

2013

EPPO Bulletin

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Section: Polymerase Chain Reaction Methodsmentioning

confidence: 99%

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PM 7/110 (1) Xanthomonas spp. (Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas vesicatoria) causing bacterial spot of tomato and sweet pepper

2013

EPPO Bulletin

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“…A diferenciação das espécies que formam o complexo da mancha bacteriana pode ser realizada através de ensaios bioquímicos (atividade amilolítica), patogenicidade em tomate e pimentão, mas com maior eficiência e rapidez por meio de técnicas moleculares, rep-PCR ou PCR com iniciadores específicos (Louws et al, 1995;Bouzar et al, 1999;Cuppels et al, 2006;Koenraadt et al, 2009;Pereira et al, 2011). A técnica de rep-PCR com o iniciador BOX apresenta vantagens por ser rápida, de fácil execução e altamente discriminatória para espécies de Xanthomonas.…”

unclassified

“…Três amplificaram um fragmento de 654 pb contendo o gene avrXv3, característico de X. perforans e os outros dois foram confirmados com iniciadores específicos para essa espécie. Todos os isolados do presente estudo também tiveram confirmação de suas espécies com seus respectivos iniciadores específicos (Koenraadt et al, 2009), ainda em fase de validação na Embrapa Hortaliças em parceria com a Universidade de Brasília (dados não publicados).…”

unclassified

Ocorrência e caracterização do complexo de espécies causadoras da mancha bacteriana do tomateiro no Alto Vale do Rio do Peixe, SC

Costa¹,

Araújo²,

Becker³

et al. 2012

Trop. plant pathol.

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RESUMOO objetivo deste trabalho foi identificar isolados de Xanthomonas causadores da mancha bacteriana do tomateiro para consumo in natura, provenientes da região do Alto Vale do Rio do Peixe, SC, Brasil, bem como caracterizá-los quanto à sensibilidade in vitro ao cobre. As espécies foram determinadas por similaridades de perfis genômicos gerados por BOX-PCR e a sensibilidade ao cobre foi estabelecida utilizando-se o meio CYE suplementado com sulfato de cobre nas concentrações de 50, 100 e 200 μg/mL. Do total de 44 isolados, 80% foram identificados como X. gardneri, 11% como X. perforans e 9% como X. vesicatoria. De acordo com a reação ao cobre, os isolados foram agrupados em quatro classes (S, sensíveis; MS, moderadamente sensíveis; MI, moderadamente insensíveis; I, insensíveis). Quanto à sensibilidade ao cobre, 98% de todos os isolados foram sensíveis a 200 μg/mL, sugerindo que aparentemente, a dosagem recomendada de produtos à base de cobre em campo, 10 vezes maior que a dosagem limítrofe utilizada nos testes in vitro, ainda é eficiente para as diferentes espécies da bactéria. Palavras-chave: Xanthomonas euvesicatoria, X. gardneri, X. perforans, X. vesicatoria, BOX-PCR, cobre, controle químico. ABSTRACT Occurrence and characterization of the species complex causing tomato bacterial spot in "Alto Vale do Rio do Peixe", SC, BrazilThe aim of this study was to identify at the species level Xanthomonas strains causing tomato bacterial spot in the region of "Alto Vale do Rio do Peixe", state of Santa Catarina, Brazil, as well as to determine their in vitro sensitivity to copper. Species were determined by similarity analysis of genomic profiles generated by BOX-PCR and sensitivity to copper was established using the CYE medium supplemented with copper sulfate at concentrations of 50, 100 and 200 μg/mL. Of the 44 isolates, 80% were identified as X. gardneri, 11% as X. perforans and 9% as X. vesicatoria. According to the response to copper, the isolates were divided into four classes (S, sensitive; MS, moderately sensitive; MI, moderately insensitive; I, insensitive). Regarding the sensitivity to copper, 98% of all isolates were sensitive at 200 μg/mL, suggesting that the recommended dosage of copper-based products registered for the crop may still provide effective control of the different bacterial species.

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First report of Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria causing bacterial leaf spot in chilli pepper (Capsicum sp.) in Indonesia

Utami,

Jayasanti,

Meale

et al. 2023

New Disease Reports

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Development of Specific Primers for the Molecular Detection of Bacterial Spot of Pepper and Tomato

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PM 7/110 (1) Xanthomonas spp. (Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas vesicatoria) causing bacterial spot of tomato and sweet pepper

PM 7/110 (1) Xanthomonas spp. (Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas vesicatoria) causing bacterial spot of tomato and sweet pepper

Ocorrência e caracterização do complexo de espécies causadoras da mancha bacteriana do tomateiro no Alto Vale do Rio do Peixe, SC

First report of Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria causing bacterial leaf spot in chilli pepper (Capsicum sp.) in Indonesia

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