Crossodactylus gaudichaudii é endêmica do Brasil, do bioma Mata Atlântica, com registros de ocorrência nos estados do Rio de Janeiro, Minas Gerais e São Paulo. Sua extensão de ocorrência foi calculada em 42.157 km². Trata-se de espécie comum, habita riachos em ambientes florestadas, não ocorrendo em áreas abertas. Embora haja perda de vegetação nativa em algumas localidades ao longo de sua distribuição, não há evidência de ameaças que possam colocar a espécie em risco de extinção em curto prazo. Por essas razões, Crossodactylus gaudichaudii foi avaliada como Menos Preocupante (LC).