Resumo: O crescimento desordenado das cidades contribui para a degradação dos corpos hídricos, comprometendo a qualidade de vida da população. Este trabalho visou diagnosticar os impactos ambientais presentes em corpos hídricos dentro do perímetro urbano no município de São João da Baliza -RR, através da aplicação de protocolo de integridade ambiental adaptado por Callisto et al. (2002). Foram definidos 5 corpos hídricos na área urbana do município, totalizando 15 protocolos. Os resultados classificaram os corpos hídricos na categoria de "impactado". Foram observadas interferências na vegetação no entorno dos corpos hídricos, bem como a presença de empreendimentos caracterizados por desenvolver atividades potencialmente poluidoras ao meio ambiente tais como oficinas mecânicas, marcenarias, postos de lavagem de veículos; lançamento de esgoto doméstico a céu aberto; além de construções e infraestruturas desprotegendo as margens dos corpos hídricos. As análises de turbidez apresentaram resultados relevantes, principalmente, no corpo hídrico 4, no qual todos os trechos avaliados estão acima do limite máximo de até 100 UNT, valor este recomendado pela resolução 357/2005 do CONAMA. Observa-se a necessidade de ações voltadas a recuperação da qualidade dos corpos hídricos, principalmente no corpo hídrico 4, pois ocorre abundantemente o despejo de resíduos sólidos, causando impactos ao meio ambiente.