> Les caractères complexes, comme la vulnérabi-lité des personnes à une maladie commune, sont contrôlés par des régions génomiques nombreuses dont les effets phénotypiques sont généralement faibles. Partant de ce constat, des généticiens ont développé un nouveau système expérimen-tal pour disséquer la génétique des caractères complexes chez la souris. Le Collaborative Cross est une population génétique de référence comprenant plus de 300 lignées consanguines issues de huit lignées appartenant à trois sousespèces de Mus musculus et ayant capturé 90 % du polymorphisme connu chez la souris. Nous décrivons ici la fabrication et les propriétés du Collaborative Cross et rapportons les résultats des premières expériences effectuées sur des lignées en cours d'obtention. < une myriade de gènes aux effets très réduits 1 , parfois par quelques gènes ayant des effets moyens, quasiment jamais par des gènes ayant un effet important [2,3]. Le contrôle d'environ 50 % du risque de développer une dégénérescence maculaire liée à l'âge par seulement cinq variants fréquents semble bien être une exception [4,37]. De plus, les GWAS réalisées sur quelques milliers de cas et témoins n'ont généralement pas la puissance nécessaire pour identifier les gènes directement responsables d'un risque accru [38]. Pour ces raisons, les bases génétiques des maladies communes demeurent pour l'essentiel inconnues. Le seul recours semble être actuellement d'augmenter la taille des cohortes analysées pour inclure plusieurs dizaines de milliers d'individus [5,6].
Limites de l'approche QTL chez la souris pour l'étude des caractères complexesLes données obtenues chez des espèces d'élevage et des animaux de laboratoire confirment ce modèle où l'héritabilité des caractères complexes est due à un nombre important de gènes ayant de faibles effets [7,8]. En dépit d'une architecture génétique identique, l'étude des caractères complexes chez les rongeurs est rendue plus aisée par la possibilité de contrôler finement les variables environnementales et de réaliser des croisements prédéfinis. Mais l'atout majeur du généticien reste l'existence de lignées consanguines, des populations d'individus génétiquement identiques et homozygotes à tous les locus de leur génome [9]. La stratégie classique pour disséquer la composante génétique d'un caractère complexe chez la souris est illustrée 1 L'effet d'une région génomique se mesure par la différence de risque, pour un individu, de développer la maladie selon qu'il porte l'un ou l'autre allèle présent dans la population.Génétique fonctionnelle de la souris, URA CNRS 2578, Institut Pasteur, 25, rue du Docteur Roux,