Analysis of the genetic variability of peach palm (Bactris gasipaes) in the Yurimáguas region, Peru, using molecular RAPD markers

Abstract

Molecular markers were used to verify the existence of one or more primitive peach palm landraces, including Pampa Hermosa, in the microregion near Yurimáguas, Peru. This region provides the highest amount of seeds for peach palm heart agribusinesses in Brazil. In this analysis, we used 120 peach palm plants (Bactris gasipaes var. gasipaes) from four river basins around Yurimáguas. We used six primers, generating 73 RAPD markers. The heterozygosity ranged from 0.29 to 0.31, with a mean of 0.32, and the percentage of polymorphism ranged from 80.8 to 86.6, with a mean of 90.4. The dendrogram, based on Jaccard Similarity, presented eight groups, but it did not present groups formed by the water basins. The average gene flow was high, ranging from 11.41 to 18.89, as expected for populations within a same landrace. The analysis of the genetic diversity in this set of plants showed a common genetic basis among the plants. Nei's Genetic Distances were low, varying between 0.012 and 0.027. This suggests that such populations are very similar to each other, and that there is only one landrace in the region. Therefore, we propose the existence of only one landrace in the Yurimáguas region and the name "Pampa Hermosa" should be adopted.Additional keywords: gene flow; genetic analysis; genetic distances; primitive landraces. ResumoMarcadores moleculares foram utilizados para verificar a existência de uma ou mais raças primitivas de pupunha, além de Pampa Hermosa, na microrregião próxima de Yurimáguas, Peru, que fornece a maioria das sementes para o agronegócio de palmito de pupunha no Brasil. Nesta análise, foram utilizadas 120 plantas de pupunha (Bactris gasipaes var. gasipaes) de quatro bacias hidrográficas ao redor de Yurimáguas. Seis iniciadores foram utilizados, gerando 73 marcadores RAPD. A heterozigosidade variou de 0,29 a 0,31, com média de 0,32, e a porcentagem de polimorfismo variou de 80,8 a 86,6, com média de 90,4. O dendrograma baseado nas Similaridades de Jaccard apresentou oito grupos, porém sem apresentar grupos definidos com base nas bacias hidrográficas. O fluxo gênico médio foi alto, variando de 11,41 a 18,89, como esperado para populações dentro de uma raça. A análise da diversidade genética nesse conjunto de plantas mostrou uma base genética comum entre essas plantas. As Distâncias Genéticas de Nei foram muito pequenas, variando de 0,012 a 0,027, sugerindo que essas populações são muito similares entre si e que existe uma só raça na região. Portanto, foi proposta a existência de apenas uma raça na região de Yurimáguas, e o nome Pampa Hermosa deve ser conservado.Palavras-chave adicionais: análise genética; distâncias genéticas; fluxo gênico; raças primitivas.