A relative expression of Xa7 gene controlling bacterial leaf blight resistance in indonesian local rice population (Oryza sativa L.)

Deployment of Genetic and Genomic Tools Toward Gaining a Better Understanding of Rice-Xanthomonasoryzae pv. oryzae Interactions for Development of Durable Bacterial Blight Resistant Rice

“…In this method, PCR amplification of homologs from different wild and cultivated germplasm is performed and analyze the PCR amplicon. This method is known as allele mining, and it has been widely studied for BB resistance genes such as Xa7 ( Utami et al., 2013 ), Xa27 ( Bimolata et al., 2013 ), Xa26 , Xa21 , and xa5 ( Bimolata et al., 2015 ), etc. This method will also reveal the degree of conservation among genes and other regulatory regions across the species.…”

“…One such example is Xa7 , which has been used to develop BB resistance rice varieties ( Perez et al., 2008 ; Utami et al., 2010 ). Allele mining approach was applied in the local rice accessions of Indonesia (Parekaligolara) to isolate resistant alleles of Xa7 ( Utami et al., 2013 ). Subsequently, these accessions containing variant alleles with respect to Xa7 have been used as for developing new BB resistant rice lines ( Utami et al., 2013 ).…”

PATOGENISITAS ISOLAT BAKTERI Xanthomonas oryzae pv. oryzae DAN PEMANTAUAN PENYAKIT HAWAR DAUN BAKTERI PADA PADI GALUR ISOGENIK

“…Mayoritas varietas padi di Asia Tenggara mempunyai gen tahan X a7, karena IRBB7 secara luas digunakan sebagai donor dalam program pemuliaan untuk meningkatkan ketahanan padi terhadap penyakit HDB (Vera Cruz et al, 2000;Suwarno et al, 2001;Utami et al, 2013). Sebagian besar isolat Xoo yang diuji dalam penelitian ini kurang virulen terhadap galur isogenik yang Tabel 3.…”

“…Reaksi padi diferensial NIL yang mengandung gen ketahanan berbeda terhadap HDB (gen tunggal dan kombinasi gen) pada uji di lapangan (Cianjur, Jawa Barat mengandung gen X a21. Galur padi dengan gen tahan Xa21 juga dilaporkan efektif dan stabil terhadap beberapa isolat Xoo (Utami et al, 2013) yang juga sejalan dengan penelitian ini. Namun, hingga saat ini, galur padi yang membawa gen X a21 belum ditanam di daerah yang luas untuk jangka waktu yang lama, sehingga daya tahan gen ketahanan X a21 di lokasi tertentu masih belum jelas.…”

“…Perkembangan terbaru dalam bidang kloning gen untuk ketahanan terhadap penyakit utama (Utami et al, 2013) memungkinkan penggabungan gen untuk ketahanan terhadap patotipe tertentu ke dalam genotipe dengan ketahanan kuantitatif (horizontal resistance). Ketersediaan peta linkage molekul padi memungkinkan untuk mengidentifikasi cepat dan melokalisasi beberapa gen ketahanan HDB (Sanchez et al, 2000).…”