Uso do algoritmo de Gower na determinação da divergência genética entre acessos de tomateiro do grupo cereja

Abstract

RESUMO.A análise conjunta de variáveis qualitativas e quantitativas tem sido apontada como ferramenta útil na estimativa da divergência genética entre os acessos de uma coleção de germoplasma. O presente trabalho teve como objetivos caracterizar uma coleção de germoplasma de tomateiro do grupo cereja, com base em descritores qualitativos e quantitativos e utilizar o algoritmo de Gower na quantificação da divergência genética. Estudaram-se 40 acessos de tomateiro cereja, cultivados em manejo orgânico nas condições de Seropédica, Estado do Rio de Janeiro. Foram utilizados quatro descritores qualitativos relacionados aos frutos e nove descritores quantitativos. Os dados foram analisados de forma conjunta pelo algoritmo de Gower. Detectou-se variabilidade para coloração, formato e número de lóculos do fruto. A coloração vermelha foi observada em 25 acessos testados, registrando-se também a produção de frutos amarelos, laranjas e marrons. Para número de lóculos, foi registrada a ocorrência de frutos bi, tri, tetra e pluriloculares (com até sete lóculos). O método UPGMA foi o que obteve o maior coeficiente de correlação cofenética (0,80), observando-se a formação de sete grupos. Os grupos formados permitiram a distinção de frutos classificados como cereja e outros que não se adequaram a esta definição, por estarem acima do diâmetro equatorial proposto para esta classe.Palavras-chave: Solanum lycopersicum, análise multivariada, descritores qualitativos, descritores quantitativos, programa R.ABSTRACT. Using Gower's algorithm on the genetic divergence determination among cherry tomato accessions. The joint analysis of qualitative and quantitative variables has been considered a useful tool to estimate the genetic divergence among accessions of a gene bank. The purpose of this research was: (i) to characterize a collection of cherry tomatoes, using quantitative and qualitative descriptors, and (ii) to use Gower's algorithm to quantify genetic divergence among genotypes, employing a joint descriptors analysis. Forty accessions of organically grown cherry tomato were studied in Seropedica, Rio de Janeiro, Brazil. Four qualitative fruit descriptors and nine qualitative descriptors were used. Data were analyzed using Gower's algorithm. There was variability for color, shape and number of locules per fruit. The red color was observed in fruits of 25 accessions. Fruit with different colors such as yellow, orange and brown were also observed. Regarding locule number, the presence of fruit with two, three, four and even with seven locules was detected. The UPGMA method resulted in the highest value for cophenetic correlation (0.80) and seven clusters were formed. The formed clusters made it possible to distinguish fruit classified as cherry tomato from other type grouped in different clusters, because the fruits this category were larger than cherry type considering the equatorial diameter of the fruit.

Estimativa da divergência entre ecótipos de braquiária baseada em descritores quantitativos e qualitativos

“…ROCHA et al (2010) e MOURA et al (2010, ao utilizarem o algoritmo de Gower na estimativa da divergência genética em germoplasma de pimenta verificaram maior eficiência na disjunção dos genótipos, quando foram utilizadas as variáveis qualitativas em comparação às quantitativas, discordando da presente pesquisa. Entretanto, o fato dos descritores quantitativos terem sido mais discriminantes não invalida a necessidade de utilizar descritores qualitativos nos estudos de divergência genética em U. brizantha, pois estes caracteres, como o teor de proteína bruta e digestibilidade in vitro da matéria orgânica, por exemplo, são informações relevantes em programas de melhoramento desta espécie.…”

“…A geração de um grande número de dados de diferentes categorias pode dificultar tanto a análise como a interpretação dos resultados de caracterização e avaliação do germoplasma, muitas vezes, resultando na incompleta distinção entre os ecótipos (ROCHA et al, 2010). Sendo assim, a análise conjunta das variáveis pode fornecer melhor indicação da potencialidade da variabilidade existente em bancos de germoplasma.…”

“…(ROCHA et al, 2010). Sob a hipótese de distinção e caracterização de ecótipos promissores no melhoramento genético de U. brizantha, objetivou-se com o presente estudo estimar a divergência genética entre ecótipos desta espécie, com base na análise de descritores quantitativos, qualitativos e sua análise conjunta e indicar combinações promissoras para a produção de híbridos.…”

Divergência genética entre acessos de mamoeiro por meio de variáveis morfoagronômicas

“…Essa mesma metodologia, também foi utilizada por Rodríguez et al (2005) para estudar conjuntamente variáveis qualitativas e quantitativas, oriundas de 28 descritores morfoagronômicos em Brassica napus L. Os autores verificaram que a análise conjunta dos dados utilizando a distância de Gower permitiu uma boa estimação da variabilidade.…”

Genetic divergence among pumpkin landraces

“…Jointly analyzing quantitative and qualitative variables can provide a better indication of existing variability (ROCHA et al, 2010). Gower's distance (1971) is a lowcomplexity joint analysis procedure which has been used in several characterization and evaluation studies of germplasms (BERTAN et al, 2009;GONÇALVES et al, 2008;MOURA et al, 2010;QUINTAL et al, 2012;ROCHA et al, 2010;RODRÍGUEZ et al, 2005;TSIVELIKAS et al, 2009;VIEIRA et al, 2007). Therefore, in this study, we conducted joint analysis to characterize and evaluate the genotypic divergence of 14 accessions of Cucurbita moschata collected in the northern region of the State of Rio de Janeiro using qualitative and quantitative variables.…”