Molecular characterization of a proteolysis-resistant lipase from Bacillus pumilus SG2

Abstract

Proteolysis-resistant lipases can be well exploited by industrial processes which employ both lipase and protease as biocatalysts. A proteolysis resistant lipase from Bacillus pumilus SG2 was isolated, purified and characterized earlier. The lipase was resistant to native and commercial proteases. In the present work, we have characterized the lip gene which encodes the proteolysis-resistant lipase from Bacillus pumilus SG2. The parameters and structural details of lipase were analysed. The lip gene consisted of 650 bp. The experimental molecular weight of SG2 lipase was nearly double that of its theoretical molecular weight, thus suggesting the existence of the functional lipase as a covalent dimer. The proteolytic cleavage sites of the lipase would have been made inaccessible by dimerisation, thus rendering the lipase resistant to protease.

A Heating-Superfusion Platform Technology for the Investigation of Protein Function in Single Cells

“…The measured rates were in agreement with previous reports, which show the influence of temperature on AP 33,34 and protease, 35 showing that the optimum activity was observed at physiological temperatures.…”

Determinación de secuencia y modelaje por homología de la lipasa de Marinobacter sp. LB

“…La secuencia aminoacídica inmadura es de 308 residuos, el tamaño de estas proteínas depende de la familia a la que pertenece, la especie y del espacio donde actúa. Así mismo, las lipasas extracelulares bacterianas por lo general presentan un péptido señal (Ihara et al 1991, Frenken et al 1992, Sangeetha et al 2014, Sullivan et al 1999, Park et al 2009 en la región N-terminal, reconocido por receptores de membrana y proteínas de secreción que permiten su salida al medio externo . En tal sentido, el reconocimiento de un péptido señal de 24 aa en la secuencia de la lipasa, se puede sustentar con los trabajos realizados por Alejandro-Paredes (2012) y Fernández-Jerí et al (2013) quienes describen que la lipasa de Marinobacter sp.…”

“…LB, presentó 11 α-hélices periféricas y 9 láminas-β ubicadas principalmente en la región central, similar a lo descrito por Messaoudi et al (2011) quienes describen en su modelo 8 láminas-β centrales. El plegamiento y estabilidad de nuestra lipasa depende de: los puentes de hidrógeno, entre aminoácidos polares; interacciones hidrofóbicas, entre residuos apolares (glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina); y un puente disulfuro generado entre los grupos tiol (-SH) de los residuos Cys180 y Cys235, también descrito por Frenken et al (1992), An et al (2003), Sangeetha et al (2014) y Sullivan et al (1999). En relación al RMSD, los modelos que presentan un porcentaje de identidad entre 90% a 95%, suelen tener valores entre 1 y 0.5 Å (Rost 1999, Vivas-Reyes et al 2010, por lo que puntuaciones inferiores a 0.5 Å deben considerarse estructuralmente confiables, tal como sucede con el valor de 0.32 Å obtenido con Swiss-PDB Viewer (Guex & Peitsch 1997).…”

Optimization of medium components and physicochemical parameters to simultaneously enhance microbial growth and production of lypolitic enzymes by Stenotrophomonas sp.

“…Sangeetha et al. isolated a Bacillus pumilus SG2, which presented an optimum pH for LP at 9.0. In the same way, Kumar et al.…”