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“…Outros dois sistemas de sequenciamento que começam a ser utilizados são a plataforma da Applied Biosystems, denominada SOLiD System, e o HeliscopeTrue Single Molecule Sequencing (tSMS), da Helicos (Carvalho & Silva, 2010).…”
Section: Sequenciamento Massivo (Pirosequenciamento-454)unclassified
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“…Outros dois sistemas de sequenciamento que começam a ser utilizados são a plataforma da Applied Biosystems, denominada SOLiD System, e o HeliscopeTrue Single Molecule Sequencing (tSMS), da Helicos (Carvalho & Silva, 2010).…”
Section: Sequenciamento Massivo (Pirosequenciamento-454)unclassified
“…Em seguida, esse pirofosfato é convertido à ATP, pela ATP sulfurilase, sendo este utilizado pela luciferase para oxidar a luciferina, produzindo um sinal de luz capturado por uma câmera CCD (chargecoupled device) acoplada ao sistema (Figura 2.3) (Carvalho & Silva, 2010).…”
Section: Sequenciamento Massivo (Pirosequenciamento-454)unclassified
“…Quando se confirma a similaridade com a proteína almejada a sequência foi traduzida (no quadro de leitura correspondente da sequência de maior similaridade encontrada no banco de dados NR) usando a ferramenta de Translate do Expasy Tools (web.expasy.org/translate). Algumas vezes se observa que a sequência aparece em dois quadros de leitura diferentes, o que causa uma interrupção na apresentação gráfica dada pelo Blast X. Isso ocorre devido ao tipo de seqüenciamento realizado pelo 454, onde é difícil conseguir uma resposta linear quando várias bases do mesmo tipo estão lado a lado (Carvalho & Silva, 2010). Nesse caso, usando a sequência mais semelhante àquela que apresenta problema, verifica-se qual é o aminoácido no qual houve o problema e utilizando uma tabela com os códons para os diversos aminoácidos, verifica-se qual a base que pode ser removida ou adicionada para que a sequência fique em um único quadro de leitura.…”
Section: Curagem Das Sequênciasunclassified
“…O método se baseia na fragmentação do genoma de um organismo e realização de PCR em emulsão com pequenas esferas magnéticas.O sequenciamento de cada fragmento pode ser feito a partir de biblioteca de tags únicas, com fragmentos de 60-90 pb, ou duplas, com fragmentos de 1-10 Kb (CARVALHO; SILVA, 2010;MARDIS, 2008).…”
Section: Plataforma Solidunclassified