Micotoxinas são metabólitos secundários, produzidas por algumas espécies de fungos toxigênicos, passíveis de causarem efeitos tóxicos em humanos e animais. A contaminação de alimentos por micotoxinas tem sido relatada no mundo todo, principalmente em alimentos susceptíveis ao crescimento fúngico, como os grãos e cereais. O objetivo desta revisão bibliográfica é relatar algumas das pesquisas realizadas com micotoxinas em alimentos no Brasil, nos últimos 10 anos. O amendoim tradicionalmente tem apresentado elevados índices de contaminação por aflatoxinas. A presença de fumonisina tem sido relatada em milho e seus derivados também em níveis preocupantes. A ocorrência de micotoxinas em produtos de origem animal tem sido detectada, porém, com baixos índices de contaminação. Outros alimentos, como o trigo, milho pipoca, café, suco de maçã e cerveja apresentaram contaminação por desoxinivalenol, ocratoxina ou patulina, contudo, não existe legislação brasileira que estabeleça limites para estas micotoxinas. O monitoramento de micotoxinas em alimentos é de extrema importância para a saúde pública, visando a adoção de medidas tecnológicas, a fim de reduzir a exposição a alimentos considerados de risco para estas toxinas.