What can digital transcript profiling reveal about human cancers?

Nódulos com diagnóstico de padrão folicular: marcadores biológicos são o futuro?

“…Esta metodologia foi escolhida porque, diversamente dos microarrays que se caracterizam por serem sistemas fechados, os quais investigam os genes presentes em uma determinada plataforma, SAGE nos permitiria identificar e quantificar "todos os genes" expressos em uma determinada amostra. Para maiores detalhes da metodologia, consultar as referências (67,68). A análise realizada usando SAGE e subseqüente validação dos genes candidatos por PCR em tempo real permitiu identificar quatro novos marcadores, DDIT3, ARG2, ITM1 e C1orf24.…”

NMR Structure and Functional Characterization of a Human Cancer-related Nucleoside Triphosphatase

“…These mRNAs encode cancer-related proteins with above-average propensity to have a role in tumor invasion or other aspects of tumor development. [1][2][3] Structural characterization of as yet unknown cancer-related proteins may provide initial insight into their function, and may serve as a basis for further biochemical studies of previously unknown regulatory cell cycle pathways. Here we identified new cancer-related proteins by screening the Cancer Genome Anatomy Project database (CGAP ‡) 4 for human expressed sequence tags (ESTs) that have different expression profiles in cancerous cell lines and tissues when compared to their counterparts in normal tissue.…”

Identificação de genes diferencialmente expressos em árvores de Eucalyptus grandis susceptíveis e resistentes à Puccinia psidii

“…Complementa os resultados obtidos com a metodologia de microarrays, no estudo de transcrissomas e na identificação de transcritos novos. Por exemplo, no genoma humano Chen et al (2002) utilizaram-se da técnica de SAGE com sucesso, em áreas complexas como a medicina cardiovascular (PATINO et al, 2003); na comparação entre os padrões de níveis de transcrição em distintas regiões do cérebro (DE CHALDÉE et al, 2003); no estudo de doenças como câncer (CERUTTI et al, 2003;WEERARATNA, 2003); no estudo do sistema imune de humanos, como por exemplo, na regulação das células T, que apresentam enormes perspectivas no campo dos transplantes de órgãos, mais especificamente, no estudo da tolerância a transplantes (COBBOLD et al, 2003). Esta tecnologia também foi utilizada em animais simples como C. elegans.…”