Composição diferencial das comunidades bacterianas na rizosfera de variedas de cana-de-açúcar

Abstract

RESUMOA cultura da cana-de-açúcar é de extrema importância no cenário agrícola nacional. No entanto, pouco se sabe sobre a estruturação das comunidades microbianas associadas aos solos e às rizosferas de tais plantas. O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura e diversidade das comunidades de bactérias associadas ao solo e à rizosfera de seis variedades de cana-de-açúcar cultivadas no Estado de São Paulo (Brasil). As análises foram realizadas com base em métodos independentes de cultivo, em que a técnica de PCR-DGGE revelou alterações na rizosfera para os grupos de bactérias totais e também para os grupos de Alphaproteobacteria e Betaproteobacteria. Após essa análise, quatro amostras (três de rizosfera e uma de solo) foram usadas para o sequenciamento da região V6 do gene 16S DNAr na plataforma Ion Torrent™. Essa análise gerou um total de 95.812 sequências, dentro das quais houve a predominância das afiliadas aos filos Actinobacteria, Proteobacteria e Acidobateria. Os resultados revelaram que as comunidades bacterianas na rizosfera são distintas daquelas encontradas no solo. Foi possível ainda observar efeito diferencial de plantas das variedades. Alguns grupos bacterianos apresentaram menor frequência na rizosfera (Acidobacteria), enquanto outros se mostraram fortemente estimulados pela presença das raízes, comumente para todas as variedades (Betaproteobacteria, Nitrospora e Chloroflexi), ou em respostas variedade-específicas (Bacilli e Sphingobacteria).Termos de indexação: métodos independentes de cultivo, genes ribossomais, diversidade bacteriana, sequenciamento de DNA.(1) Trabalho extraído da Dissertação de Mestrado do primeiro autor. Recebido em 20 de fevereiro de 2014 e aprovado em 5 de setembro de 2014.

Diazotrophic bacteria isolated from Brachiaria spp.: genetic and physiological diversity

“…The bacterial classes Gammaproteobacteria and Betaproteobacteria comprised 65% of bacterial isolates (Table 1). The bacteria from this class responded to chemotactic factors of root exudates and were thus abundant in rhizospheric soils (Costa et al, 2014). However, the profile of exudates dif- fered according to genotype, phenological status, plant nutrition, and seasonality (Murphy et al, 2016).…”

Bacteria associated with sugarcane in Northeastern Brazil

“…In sugarcane, the studies have focused on varieties cultivated in Southeast region of the country and have found important bacterial groups that perform BNF (Rennie et al, 1982;Oliveira et al, 2002;Loiret et al, 2004;Perin et al, 2004;Reis et al, 2004;Luvizotto et al, 2010;Costa et al, 2014). Resende et al (2006) reported that biological N 2 fixation (BNF) performed by bacteria associated with sugarcane can be responsible for up to 60% of the total N accumulated in the plants.…”

Cultivo de bactérias da rizosfera da cana-de-açúcar e a interferência dos exsudatos da planta em seu desenvolvimento

“…Em todos os sistemas foram inoculados 1l de suspensão bacteriana a absorbância de 0,2(OD 600nm ). Todas as curvas de multiplicação celular foram realizadas em quadruplicadas, com leituras em absorbância com comprimento de onda 600nm (ZHANG et al, 2014) Estes resultados deram suporte à caracterização de um grupo de 280 isolados por meio da técnica de BOX-PCR, como utilizado em outros estudos que buscam uma melhor caracterização de culturas bacterianas (HUNGRIA et al, 2008;WONG, 2009;MARQUES et al, 2008;SOARES JÚNIOR et al, 2013 (COSTA et al, 2014;DINI-ANDREOTE et al, 2010;MENDES et al, 2007).…”

“…Devido a isto, estudos relativos ao aprimoramento das condições de cultivo são de grande interesse, surgindo diversas fontes de estudos, dentre as quais está à busca por um melhor conhecimento sobre as comunidades microbianas associadas ao processo produtivo da cana-de-açúcar. Actinobacterias (COSTA et al, 2014;DINI-ANDREOTE et al, 2010;MENDES et al, 2007;PHILIPPOT et al, 2013;PISA et al, 2011).…”