Using community phylogenetics to assess phylogenetic structure in the Fitzcarrald region of Western Amazonia

Abstract

Here we explore the use of community phylogenetics as a tool to document patterns of biodiversity in the Fitzcarrald region, a remote area in Southwestern Amazonia. For these analyses, we subdivide the region into basin-wide assemblages encompassing the headwaters of four Amazonian tributaries (Urubamba, Yuruá, Purús and Las Piedras basins), and habitat types: river channels, terra firme (non-floodplain) streams, and floodplain lakes. We present a robust, well-documented collection of fishes from the region including 272 species collected from 132 field sites over 63 field days and four years, comprising the most extensive collection of fishes from this region to date. We conduct a preliminary community phylogenetic analysis based on this collection and recover results largely statistically indistinguishable from the random expectation, with only a few instances of phylogenetic structure. Based on these results, and of those published in other recent biogeographic studies, we conclude that the Fitzcarrald fish species pool accumulated over a period of several million years, plausibly as a result of dispersal from the larger species pool of Greater Amazonia.

Drivers of phylogenetic structure in Amazonian freshwater fish assemblages

“…As far as we know, this is the first study applying this phylogenetic framework and its drivers at the scale of the whole Amazon basin (but see e.g. : Craig et al, 2020 for an application at more regional scale and Dagosta et al, 2021). These contrasting signatures were related to various historical and contemporary drivers most often similar, as expected, to the ones related to richness and endemism patterns (Oberdorff et al, 2019).…”

Ecologia Filogenética De Comunidades De Peixes De Riacho Neotropicais

“…Estudos também evidenciam como eventos geológicos, como a mudança de um riacho de cabeceira de uma bacia para outra ou a formação das drenagens atuais, promovem a dispersão de peixes entre áreas contíguas e a homogeneização da diversidade filogenética (Aquino & Colli 2017, Abreu et al 2019, Craig et al 2020.…”

“…Neste artigo, discutiremos os principais conceitos que baseiam a ecologia filogenética, revisamos como a história evolutiva estrutura a variação ecológica de peixes em nível de organismo e de comunidades, bem como apresentamos o potencial destes conceitos para auxiliar no entendimento dos padrões das comunidades de peixes de riachos Neotropicais. Também sumarizamos os principais resultados encontrados neste contexto, apesar do baixo número de artigos que abordem a temática até onde conhecemos: dois artigos sobre sinal filogenético (Roa-Fuentes et al 2015, Keppeler & Winemiller 2020, oito sobre estrutura de comunidades (Aquino & Colli 2017, Abreu et al 2019, Bowen & Winemiller 2019, Craig et al 2020, Nakamura et al 2017, Roa-Fuentes et al 2019 e nenhum com uma abordagem diretamente filogenética na conservação. Em seguida, na seção Aspectos Metodológicos, apresentaremos as principais ferramentas que podem ser aplicadas para o estudo da ecologia filogenética, incluindo a construção de árvores filogenéticas, métodos comparativos de atributos das espécies e análises da estrutura das comunidades.…”

Drivers of phylogenetic structure in Amazon freshwater fish assemblages

“…On the other hand, assemblages composed of species from distinct evolutionary lineages (i.e. overdispersed assemblages) indicate the role of dispersal assemblage formation (Craig et al, 2020;Dexter et al, 2017;Tucker et al, 2017;Webb, 2000). Understanding these processes can shed light on evolutionary community assembly and on the effects of historical drivers on current distribution patterns (Crouch et al, 2019;Dexter et al, 2017;Graham, 2003;Leprieur et al, 2016;Pyron & Burbrink, 2014;Qian et al, 2020;Sandel et al, 2020).…”