O objetivo deste trabalho foi verificar a ocorrência de doenças infecciosas e parasitárias em caprinos e ovinos da região metropolitana de São Luís, estado do Maranhão. Para detecção de anticorpos anti-vírus de Maedi-Visna e para o diagnóstico da artrite encefalite caprina, foi utilizada a técnica de imunodifusão em gel de ágar (IDGA). Para identificação dos endoparasitas, utilizou-se a técnica de McMaster. A realização das coletas dos ectoparasitas foram feitas por inspeção e palpação nos animais, sendo os carrapatos examinados posteriormente em estereomicroscópio e identificados através de chave dicotômica; já os piolhos foram montados entre lâmina e lamínula. As análises revelaram a prevalência de Maedi-Visna em 1,02% dos 98 ovinos amostrados, e foram constatados anticorpos contra o vírus da Artrite Encefalite Caprina em 2,29% do rebanho caprino (87). Dentre as 170 amostras fecais de caprinos e ovinos examinadas, verificou-se que em 84,1% continham ovos do tipo Strongyloidea e Moniezia sp. e oocistos de Eimeria sp. Em apenas 6,9% dos 87 caprinos inspecionados, foi encontrado algum espécime de ectoparasita. As espécies de piolhos identificadas neste estudo foram Bovicola caprae e Linognathus africanus. A espécie de carrapato identificada parasitando os caprinos foi Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Concluiu-se que a infecção por Maedi Visna, Artrite Encefalite Caprina, ectoparasitoses e endoparasitoses estão presentes em ovinos e caprinos da região metropolitana de São Luís, ressaltando-se a importância da implementação de políticas públicas de prevenção e controle dessas enfermidades.