iv Agradecimentos Agradeço ao meu orientador, Ricardo Krüger, pelo apoio às nossas idéias de pesquisa, esdrúxulas ou não. Obrigada pela liberdade que você nos dá no laboratório. A meu ver, um local de trabalho com liberdade, cobranças medidas e bom humor ajuda muito na fluidez da pesquisa. Seu humor, que não é fácil de entender, sempre me fez sentir em casa, e algumas das suas ironias ficarão marcadas. Tal como os momentos de geekness, como a explicação do nome de 454 para a plataforma de pirosequenciamento.Os trabalhos aqui realizados não existiriam sem o financiamento à pesquisa, especificamente pela FAP-DF, CNPq e CAPES. Agradeço especialmente à última, que financiou a minha bolsa de doutorado no país e no exterior.Agradeço às bancas de qualificação (Professoras Cristine, Mercedes e Sérgio) e de defesa (Professores Cynthia, Mercedes, Alexandre e Helson) desta tese que auxiliaram na discussão e no refinamento deste documento.Agradeço também aos professores colaboradores que fizeram parte mais diretamente das pesquisas apresentadas nesta tese: Gabriela Nardoto, Mercedes Bustamante e Jim Prosser.Entretanto, teria sido mais difícil de realizar esta tese se eu não tivesse ao meu lado parceiros de bancada e de computador: Fabyano, Ju, Re(nata) e Re(gina). E não tão diretamente relacionados ao meu dia-a-dia, mas também parte do grupo, agradeço à Débora, Paula e Samuel. E um especial obrigado à minha amiga que me chama de "orientadora -mirim", Helena Magaldi, que me ajudou muito na leitura e correção dos meus textos.Tenho um agradecimento especial a fazer ao Fabyano, parceiro científico, amigo, colega, nosso Thor do Cerrado. Aquele que me livrou de ataque de cupim e potencial ataque de suçuarana-pesquisador (?). Agradeço imensamente a oportunidade de termos trabalhado juntos. E espero que prospere o nosso plano de continuarmos colaborando em projetos futuros.A pesquisa do sisbiota só foi possível porque conseguimos (Eu e Fabyano) reunir mão-deobra amiga e voluntária para as várias coletas: Renata, Amanda, Lucas, Matias, Hugo e Huguinho.De mesma forma, consegui carregar muita gente para campo para coletar solo na Fazenda Tabapuã dos Pirineus. Agradeço especialmente ao Marciano, que esteve em todas as coletas e me auxiliou com rigor nos meus primeiros experimentos de PCR em tempo real. Agradeço também à Cecília Kosmann, à Carol Benévolo, ao Lucas Pimenta, e novamente à Ju e ao Fabyano.Um agradecimento especial deve ser feito ao Fabiano Nardoto, dono da Fazenda Tabapuã dos Pirineus. Não só permitiu o acesso livre à fazenda para os diferentes tempos de coleta, mas também nos proveu informações sobre a fazenda e a plantação de soja e de milho. 21 days it was possible to detect the activity of AOA with the quantification of amoA transcripts. Moreover, DGGE profiles showed a higher number of AOA amoA gene in the Craibstone-only slurries and similar to the mixed slurries, but lower in the Cerrado-only slurries. This was the first assessment of the N metabolism with metagenomic data and qPCR for ammonia oxidation in the Cerrad...